布朗葡萄藻A型和L型的轉(zhuǎn)錄組分析.pdf

1、布朗葡萄藻生活在淡水與海水交匯的半咸水區(qū)域，是一種能夠在細(xì)胞內(nèi)積累多種油脂和碳?xì)浠衔锏奈⒃?，這項(xiàng)能力使其逐漸步入人們的視野。根據(jù)布朗葡萄藻細(xì)胞內(nèi)積累的不同碳?xì)浠衔?，可以將其分?種不同的化學(xué)種。因?yàn)槠渖L速度比較緩慢（比如細(xì)胞加倍時(shí)間為5至7天），所以沒有廣泛的應(yīng)用于生物燃料的生產(chǎn)。為了今后能通過合成生物學(xué)途徑讓生長速度較快的微藻品系生產(chǎn)碳?xì)溆?，我們嘗試通過轉(zhuǎn)錄組分析找出與布朗葡萄藻碳?xì)溆秃铣上嚓P(guān)的基因產(chǎn)物。
　　我們研究了A

2、型藻779在氮饑餓處理時(shí)轉(zhuǎn)錄組的調(diào)控變化。我們發(fā)現(xiàn)779在光合自養(yǎng)時(shí)的平均生長速率在0.52g每升每天，氮饑餓處理后的細(xì)胞油脂含量最高可達(dá)75％的細(xì)胞干重。779與A型BOT-88的轉(zhuǎn)錄組比較發(fā)現(xiàn)它們之間存在許多對功能未知的同源序列，說明A型藻內(nèi)仍然有許多未知基因?；诖x途徑的轉(zhuǎn)錄組分析表明在對數(shù)期779細(xì)胞最活躍的的代謝途徑是能量代謝，說明779在對數(shù)期將光合能量分配去合成油脂而不是細(xì)胞生長。氮饑餓時(shí)，細(xì)胞為了快速響應(yīng)脅迫，通過轉(zhuǎn)錄

3、組調(diào)控上調(diào)產(chǎn)生還原力的代謝途徑。
　　本文同時(shí)拼接并研究了L型藻AC768的de novo轉(zhuǎn)錄組，結(jié)果表明L型與A型、B型轉(zhuǎn)錄組分別具有約20％的同源序列。將角鯊烯合酶相似的一組蛋白質(zhì)序列進(jìn)行多序列比對分析發(fā)現(xiàn)，lycopaoctaene synthase作為L型藻合成類四萜烯烴途徑第一步的催化酶，是L型藻所特有的;同時(shí)，我們也發(fā)現(xiàn)botryococcene synthase也是B型藻所特有。
　　綜上所述，A型、B型和L型