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1、浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文節(jié)旋藻分類學(xué)地位及生產(chǎn)性狀的分子標(biāo)記研究姓名:黃暉申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):生物物理學(xué)指導(dǎo)教師:汪志平20070501陣法構(gòu)建系統(tǒng)樹時(shí),先將16SrRNA、16S23SITS、23SrRNA和cpcHID操縱子4個(gè)基因串成一個(gè)4084bp的串聯(lián)序列,再分析品系間該序列的相似性與遺傳距離,進(jìn)而構(gòu)建出親緣關(guān)系樹。(3)用兩種方法構(gòu)建的系統(tǒng)樹基本一致,整個(gè)系統(tǒng)樹分成界定明確的3大簇:第1簇由Sp1l單獨(dú)形成,第Ⅱ簇由Sp1、
2、Sp2、Sp6、Sp9、SpqO、81014和Spq8組成,第1II簇由Sp3、Sp4、Sp5、sp7、Sp一8、Sp15、sp16和Sp17組成。兩棵系統(tǒng)樹的主要差異在于第1I簇,超級矩陣法將該簇分成由Sp6、Sp14和Sp18組成的一個(gè)分支和spq、sp2、Sp9和Sp10組成的另一分支;而利用超級樹法,第n簇的所有品系組成同一支系。三、節(jié)旋藻生產(chǎn)性狀優(yōu)劣評價(jià)的若干分子標(biāo)記在多年研究與生產(chǎn)實(shí)踐的基礎(chǔ)上,建立了4種能簡單、快速、有效初
3、步評價(jià)節(jié)旋藻生產(chǎn)性狀的分子標(biāo)記技術(shù)。分別如下:(1)以節(jié)旋藻生產(chǎn)性狀差的第1類品系與生產(chǎn)性狀好的第n類品系,在16S23SrRNAITS中堿基位點(diǎn)有顯著共性差異、分別位于1~50bp和281~400bp的序列(稱為ITSMarkerl和ITSMarker2),作為生產(chǎn)性狀優(yōu)劣評價(jià)的分子標(biāo)記。(2)以節(jié)旋藻生產(chǎn)性狀差的第1類品系與生產(chǎn)性狀好的第1I類品系,CpcI第1~80位氨基酸序列中第7、20、30、56和72位的共性差異,作為生產(chǎn)性
4、狀優(yōu)劣評價(jià)的分子標(biāo)記。(3)以隨機(jī)引物$35和$99分別對生產(chǎn)性狀差的第1類和生產(chǎn)性狀好的第Ⅱ類節(jié)旋藻品系作RAPD擴(kuò)增顯示出的特征性差異條帶為標(biāo)記,評價(jià)節(jié)旋藻品系生產(chǎn)性狀的優(yōu)劣。即$35和$99的擴(kuò)增條帶分別為900bp和650bp者,屬第1類品系;擴(kuò)增條帶分別為680bp和900bp者,屬第1I類品系。(4)生產(chǎn)性狀差的第1類節(jié)旋藻品系的總DNA中只含1條exDNA,而生產(chǎn)性狀好的第1I類品系有2條exDNA,可以此作為分子標(biāo)記評價(jià)
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