盧氏雞綠殼性狀分子標記的研究.pdf

1、盧氏雞是我國唯一片羽型的可產(chǎn)綠殼蛋的地方雞種，殼色有綠殼和褐殼兩種顏色。自然狀態(tài)下約有2～3％的個體產(chǎn)綠殼蛋。由于決定綠殼蛋雞殼色的Oocyan（O）基因座位位于雞一號染色體上，所以本研究從雞1號染色體上篩選出與 Oocyan基因座位緊密連鎖的兩個標記位點：微衛(wèi)星 AY493302位點和內源病毒因子 EV1位點。通過采集150只盧氏綠殼蛋雞，50只盧氏褐殼蛋雞及18只白殼地方蛋雞的血液，提取基因組DNA，進行PCR擴增，分析探討了這三種

2、殼色的基因型差異，進一步分析了三種殼色的基因型與盧氏雞的蛋殼顏色相關性，為今后進行禽類綠殼性狀的分子標記輔助選擇提供理論依據(jù)與技術支持。研究結果如下：
　　1.微衛(wèi)星 AY493302在盧氏綠殼蛋雞、褐殼蛋雞以及白殼地方蛋雞之間基因型分布差異極顯著，基因型AA（225 bp/225 bp）在盧氏雞中的頻率為0.3969，且只在盧氏綠殼蛋雞中出現(xiàn)。通過測序發(fā)現(xiàn)：盧氏綠殼蛋雞 AA基因型在19 bp處堿基和217 bp處堿基均為G；但

3、盧氏綠殼蛋雞AB基因型在19 bp處堿基卻為C，在217 bp處堿基為G。盧氏褐殼蛋雞AB基因型和白殼地方蛋雞的AB基因型則表現(xiàn)為在19 bp處堿基為C，217 bp處堿基為T。綠殼蛋雞AA基因型測序后得到的序列與NCBI數(shù)據(jù)庫進行同源序列比對，達99%同源的序列有V00425.1、J02015.1和NW_003763484.1，均位于雞的1號染色體上。
　　2. EV1標記在盧氏綠殼蛋雞、褐殼蛋雞以及白殼地方蛋雞基因型分布差異極

4、顯著，基因型AA（251 bp/251 bp）在盧氏雞中的頻率為0.4348，且只在盧氏綠殼蛋雞中出現(xiàn)。通過測序發(fā)現(xiàn)：盧氏綠殼蛋雞AA基因型在52 bp處堿基為T，54 bp處堿基為T，129 bp處堿基為A；盧氏綠殼蛋雞AB基因型在52 bp處堿基為T，54 bp處堿基為T，129 bp處堿基卻為T。盧氏褐殼蛋雞AB基因型和白殼地方蛋雞AB基因型在52 bp處堿基為G，54 bp處堿基為G，129 bp處堿基為T。將綠殼蛋雞AA基因型

5、測序后得到的序列與NCBI數(shù)據(jù)庫進行同源序列比對，結果表明：同源性最高達到89%，為序列 NW_003763686.1，位于雞的2號染色體上。
　　3.盧氏綠殼蛋雞、褐殼蛋雞和白殼地方蛋雞群體在微衛(wèi)星標記 AY493302位點和 EV1標記位點的多態(tài)信息含量值分別為0.3325、0.3750、0.3750和0.3233、0.3750、0.3750，都屬于中度多態(tài)性位點。其基因座位雜合度值分別為0.4212、0.5000、0.500