25819.鈍頂節(jié)旋藻螺旋手性的變異規(guī)律與scar分子標記研究

1、浙江大學農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學院碩士學位論文鈍頂節(jié)旋藻螺旋手性的變異規(guī)律與SCAR分子標記研究姓名：潘劍用申請學位級別：碩士專業(yè)：生物物理學指導(dǎo)教師：汪志平20100301三、基于RAPD的節(jié)旋藻螺旋手性相關(guān)SCAR分子標記的研究依據(jù)上述在Sp1和Sp1(L)中10條多態(tài)性DNA片段(編號01～10)的序列，通過PrimerPremier50軟件搜索與評價，設(shè)計了含全部或部分RAPD隨機引物、長度為2025mer的SCAR引物(對應(yīng)編號Sc0

2、1～Sol0)，進而在原藻株及其它藻株中進行多態(tài)性驗證，篩選出與節(jié)旋藻螺旋手性相關(guān)的DNA片段或基因，并作生物信息學分析。主要結(jié)果如下：(1)在用于驗證的5對左手性螺旋和手中性對應(yīng)的藻株[Sp一1和Sp1(L)、Sp一3和Sp3(L)、Sp3和Sp3(L)l、Sp10和Sp10(L)、Sp一12和Sp12(L)】，以及3株左手螺旋藻株[Sp一8、Sp9$ISp一1(L專S)】中，只有Se05保持能區(qū)分藻絲為螺旋手性和手中性的多態(tài)性，li

3、I]Sc05在螺旋手性藻絲中無擴增條帶，而在手中性藻絲中有。因此，Sc05為從RAPD標記轉(zhuǎn)化成功的SCAR標記，其擴增產(chǎn)物很可能是與節(jié)旋藻螺旋手性相關(guān)的DNA片段或基因。(2)Sc05擴增產(chǎn)物的長度為527bp，從30位堿基起有1個含起始密碼子的正向ORF，對應(yīng)165個氨基酸，所編碼的蛋白質(zhì)與細菌中硫酸酯酶同源物AtsG的前165位氨基酸具有較高相似性(63％)，且含有1個硫酸酯酶家族的保守結(jié)構(gòu)域，因而將這一在節(jié)旋藻中的硫酸酯酶同源物