東北虎種質(zhì)資源及其與幾種貓科動(dòng)物分子系統(tǒng)關(guān)系研究.pdf

1、東北虎(Panthera tigris altaica)為大型貓科動(dòng)物，主要分布于我國(guó)東北地區(qū)以及俄羅斯和朝鮮。目前我國(guó)野生東北虎的數(shù)量極少，約12-16只，是我國(guó)一級(jí)瀕危保護(hù)動(dòng)物。因此，對(duì)東北虎種質(zhì)資源進(jìn)行研究，評(píng)估其遺傳多樣性的現(xiàn)狀，并據(jù)此及時(shí)采取有效措施，對(duì)保護(hù)利用東北虎資源是具有重要意義的。在分類地位上，東北虎屬哺乳綱、食肉目、貓科、虎種中的一個(gè)虎亞種，而對(duì)其是否應(yīng)歸為豹屬，一度有些爭(zhēng)議。本研究利用微衛(wèi)星技術(shù)，對(duì)圈養(yǎng)東北虎繁育群

2、體基因組DNA的多態(tài)性進(jìn)行分析，評(píng)價(jià)其種質(zhì)資源多樣性，為更有效的保護(hù)利用東北虎資源提供理論參考，同時(shí)對(duì)所研究東北虎群體的親緣關(guān)系作了初步分析與推斷。本研究還測(cè)定了東北虎、波斯貓、非洲獅及金錢豹的線粒體DNA細(xì)胞色素6基因的部分序列(570 bp)，并進(jìn)行了序列比較和系統(tǒng)分類地位分析，為探討東北虎及幾種貓科動(dòng)物的群體遺傳多態(tài)性以及在貓科動(dòng)物中的分子系統(tǒng)關(guān)系提供理論參考。研究結(jié)果如下： 1、利用15對(duì)微衛(wèi)星引物擴(kuò)增東北虎基因組DNA

3、，15個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)均處于高度多態(tài)，平均多態(tài)信息含量為0.7140；等位基因數(shù)3-7個(gè)不等，平均等位基因數(shù)為5.53個(gè)，有效等位基因數(shù)為4.3664，表明東北虎群體所提供的多態(tài)信息含量較為豐富；平均期望雜合度為0.7504，顯示出豐富的遺傳多樣性和較高的選擇潛力。 2、歐氏距離聚類結(jié)果顯示，揚(yáng)州茱萸灣動(dòng)物園6窩東北虎中，A、B、C來(lái)自同一父親虎；D來(lái)自第二個(gè)父親虎；E、F來(lái)自第三個(gè)父親虎。來(lái)自南京珍珠泉?jiǎng)游飯@G窩東北虎，在5.25

4、水平上與揚(yáng)州的E、F聚在一起。 3、線粒體DNA Cytb部分序列共發(fā)現(xiàn)138個(gè)變異位點(diǎn)，約占分析位點(diǎn)總數(shù)的24.86％，其中單一多態(tài)位點(diǎn)18個(gè)，簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)118個(gè)，有2個(gè)位點(diǎn)插入/缺失。核苷酸位點(diǎn)有5種類型的變異，轉(zhuǎn)換占85.5％，顛換占6.52％，轉(zhuǎn)換和顛換之比為13.11，轉(zhuǎn)換與顛換在同一位置占6.52％，插入/缺失占0.73％，轉(zhuǎn)換與插入/缺失在同一位置占0.73％。共檢測(cè)到22種單倍型，均為各群體所特有，無(wú)共享單倍型

5、。群體內(nèi)單倍型多樣度差異不大，從0.7636到1.000；單倍型變異度總體為0.9571±0.017，總體上單倍型多樣度豐富。 4、東北虎、金錢豹、非洲獅、波斯貓核苷酸分歧度(Dxy)為0.05286％-0.14261％，核苷酸凈遺傳距離(Da)為0.02456％-0.12955％，kimmura雙參數(shù)距離變異0.056-0.164，總體均顯示波斯貓與其他三種貓科動(dòng)物的遺傳距離較遠(yuǎn)；Fst值顯示東北虎與金錢豹的親緣系數(shù)最近。