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文檔簡(jiǎn)介
1、東北師范大學(xué)碩士學(xué)位論文中國(guó)野生大豆6個(gè)基因SNP篩選姓名:尹光申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):遺傳學(xué)指導(dǎo)教師:王興智董英山20090501AbstractSoybean(Glycinemax)isoneofthemaineconomiccropsBecausehi曲yieldingcultivarsdominateproductionbutarerelativelyfewinnumberandaregeneticallysimilar,gen
2、eticdiversityinthesecropsispresumedtohavedeclinedtoalarminglylowlevelsThereductionofgeneticdiversitydoesnotbodewellforfuturegeneticgainsincropproductivityandcouldresultinbroadsusceptibilitytonewlyemergingdiseasesorinsect
3、pests,therebythreateninglongtermfoodandfeedsecurityDuetothehi曲degreeofgeneticdiversity,GlycinesojahasbecomeavaluablegeneticresourceforsoybeflnbreedingInthisstudythreeNmetabolismrelatedgenes:Ammoniumtransporter(AMTl)nitra
4、tetransporter2(NRT2),aspartateaminotransferase2(AspAT2);threeresistencerelatedgenes:,ABREBindingProtein9(ABP9),betainealdehydedehydrogenase(BADH),calciumdependentproteinkinase13(CPKl3)wereisolatedandclonedusingtheapproac
5、hofmolecularbiologycombinedwithbioinformatics,therelatedinformationofSNPswereobtainedandtheresultswereasthefollowing:1UsingcDNAsequencesofsomeotherspeciesasquerysequences,thehomologousExpressedSequenceTags(EST)assembledc
6、ontigsweresearchedoutonTIGRwebsite;theprimersweredesignedaccordingtothecontigssequences,andpartofsixgeneswereisolated2AllthefragmentoftheeachgenewerealingnedbyusingVectorNTIsoftware2SNPsweredetectedinAMTl,26inNRT2,66inCP
7、Kl3,12inABP93inAspATand27inBADHJustthesameasreportedbefore,thenumberofSNPsinnon—codingregionsisdoubledthatofSNPsincodingregions3StatisticsweregeneratedbyusingDnaSPsoftware50,the7cofAMTl,CPKl3,BADH,ABP9,AspAT2andNRT2are00
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