S-DNA序列偏好性的統(tǒng)計(jì)分析和分子模擬：(Rp)-GpsT等二核苷具有異常的B雙螺旋結(jié)構(gòu).pdf

1、核酸是生物體內(nèi)的重要的遺傳物質(zhì)。通過轉(zhuǎn)錄、翻譯，DNA分子決定了生物體內(nèi)的合成、催化等下游生物學(xué)功能。DNA分子的堿基、核糖、磷酸上都可能在特定的情況下發(fā)生修飾，不同的修飾類型對DNA分子的構(gòu)象影響不同，進(jìn)而可以調(diào)控不同的生物學(xué)功能，如表觀遺傳等。對這些修飾類型的研究和調(diào)控機(jī)理的闡明有助于我們研發(fā)新的治療手段、實(shí)驗(yàn)技術(shù)。本文通過基于量化計(jì)算的能量打分函數(shù)結(jié)果的統(tǒng)計(jì)分析和DNA分子動(dòng)力學(xué)模擬方法研究了磷硫?；揎棇?DNA分子的相對能量和

2、局部構(gòu)象的影響。
　　DNA骨架的磷硫酰化修飾在變鉛青鏈霉菌體內(nèi)的發(fā)現(xiàn)引起了人們對生理性磷硫?；揎椀呐d趣。盡管磷硫?；揎椩诤塑疹愃幬锏拈_發(fā)中已經(jīng)作為化學(xué)修飾已經(jīng)研究了很多年，但是人們對于該修飾類型在生命體內(nèi)的生理作用、作用機(jī)理、調(diào)控等仍然還不是很清楚。本研究分為兩大部分：第一部分是對基于量化計(jì)算的能量打分結(jié)果的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，挖掘擬合參數(shù)值在不同相鄰堿基的分布，我們發(fā)現(xiàn)磷硫?；揎椇蟮南噜弶A基的相對能量的與相鄰堿基存在顯著的相關(guān)性