三維圖形可視化在數(shù)量性狀基因定位中的應(yīng)用.pdf

1、一方面，隨著后基因時(shí)代的到來(lái)和生物信息的迅速發(fā)展，數(shù)量性狀基因(QuantitativeTraitLoci，簡(jiǎn)稱QTL)定位領(lǐng)域發(fā)展迅速。另一方面，自從上世紀(jì)80年代后期興起的可視化，在最近幾年理論發(fā)展進(jìn)入瓶頸后，試圖在應(yīng)用領(lǐng)域?qū)で笸黄?，生物信息可視化正是一個(gè)方向，隨著QTL定位模型的迅速發(fā)展，原有的文本表達(dá)方式和簡(jiǎn)單的統(tǒng)計(jì)曲線已經(jīng)不能滿足QTL研究者對(duì)結(jié)果分析和展示的需求。因此，可視化和QTL在這里找到了適合的交叉點(diǎn)?？梢暬赒TL的

2、應(yīng)用正成為QTL研究的一個(gè)熱點(diǎn)。 本文從QTL定位統(tǒng)計(jì)模型的分析開(kāi)始著手，基于改進(jìn)的MCIM模型，在分析了可視化的對(duì)象，即輸出文本結(jié)果文件后，提出了自己的可視化方法，在傳統(tǒng)的統(tǒng)計(jì)曲線圖可視化中引入了類型三維地形圖可視化效果。本文還創(chuàng)新地設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了多環(huán)境下復(fù)雜效應(yīng)的QTL和上位性的基因架構(gòu)圖可視化方案。這個(gè)方案包括自定義圖元系統(tǒng)，對(duì)檢測(cè)結(jié)果的抽象、省略、精簡(jiǎn)和分層，并在可視化中按染色體原有的物理位置生成相對(duì)的虛擬坐標(biāo)。同時(shí)，本

3、文在各個(gè)視圖中設(shè)計(jì)和實(shí)現(xiàn)了人性化的可視化交互。 本文提出的可視化方法和方案，已在計(jì)算機(jī)學(xué)院圖形圖像技術(shù)實(shí)驗(yàn)室和生物信息實(shí)驗(yàn)室合作的自主開(kāi)發(fā)軟件QTLNetwork中實(shí)現(xiàn)。QTLNetwork軟件是基于MFC的多文檔多窗口Window軟件，其中的可視化部分是基于面向?qū)ο蟮目梢暬瘓D形庫(kù)VTK開(kāi)發(fā)而成。軟件界面人性化，并整合了改進(jìn)的MCIM模型算子，擁有強(qiáng)大的可視化模塊。QTLNetwork推出后即獲得了使用者的好評(píng)。本文介紹了軟件