中國(guó)內(nèi)陸鹽湖浮游動(dòng)物DNA條形碼的構(gòu)建及其遺傳多樣性分析.pdf

1、浮游動(dòng)物作為生態(tài)系統(tǒng)中的次級(jí)生產(chǎn)力，在生態(tài)系統(tǒng)的物質(zhì)傳遞和能量循環(huán)中起到至關(guān)重要的作用，在食物鏈中能夠?qū)⑽镔|(zhì)和能量由低營(yíng)養(yǎng)級(jí)向高營(yíng)養(yǎng)級(jí)傳遞。其種類組成和數(shù)量變動(dòng)會(huì)對(duì)整個(gè)生態(tài)系統(tǒng)產(chǎn)生影響。
　　DNA條形碼(DNA barcoding)分子標(biāo)記的有效技術(shù)方法之一，可以快速準(zhǔn)確進(jìn)行物種鑒定。COI基因是線粒體基因組中的進(jìn)化速度比較穩(wěn)定的基因之一，有利于設(shè)計(jì)出通用引物，并且大多數(shù)物種的COI基因能夠成功擴(kuò)增出來(lái)，進(jìn)而有利于把COI基因作

2、為物種的DNA條形碼。在環(huán)境、生態(tài)、生物多樣性保護(hù)、食品安全、海關(guān)檢疫以及疾病防控等領(lǐng)域均得到廣泛應(yīng)用。
　　本文對(duì)中國(guó)內(nèi)陸鹽水浮游動(dòng)物的COI基因序列片段進(jìn)行擴(kuò)增、測(cè)序，分析其線粒體COI基因片段序列特征構(gòu)建分子系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，旨在探討將線粒體COI基因作為DNA條形碼用于中國(guó)內(nèi)陸鹽水浮游動(dòng)物分類鑒定的有效性和可行性，并在為其生物進(jìn)化的歷史和適應(yīng)潛力提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
　　通過(guò)基于COI基因構(gòu)建內(nèi)陸鹽湖浮游動(dòng)物DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)，

3、獲得18個(gè)優(yōu)勢(shì)種共58條COI序列。其中直額裸腹溞、矩形尖額溞、蒙古裸腹溞、咸水北鏢水蚤、英勇劍水蚤、草綠刺劍水蚤、短角異劍水蚤等的COI基因部分序列都是首次被克隆出來(lái)，為今后相關(guān)物種的研究提供強(qiáng)有力的依據(jù)。研究結(jié)果表明，裸腹溞科種間遺傳距離平均值為18.2％。對(duì)32條蒙古裸腹溞COI序列，通過(guò)序列比對(duì)拼接后，序列長(zhǎng)度均為709bp，翻譯出235個(gè)氨基酸。在所得的32條蒙古裸腹溞序列中，平均堿基含量順序?yàn)門>A>C>G。其中四種堿基中T

4、（37.66%）的平均含量最高，而C（16.08%）的平均含量最低，A+T的含量（62.48%）明顯高于G+C的含量（37.52%），具有AT堿基偏好性，種內(nèi)遺傳差異不明顯。圓形盤腸溞6個(gè)地理種群兩兩之間的遺傳距離最小的為0.4%，最大的距離已經(jīng)達(dá)到11.9%已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)達(dá)到物種劃分的閾值標(biāo)準(zhǔn)。劍水蚤科的平均遺傳距離為28.3%，其中短角異劍水蚤（Apocyclops royi）與真劍水蚤屬的遺傳距離最大（36.8%），遺傳距離最小的是Cy

5、clopidae sp.與Macrocyclops albidus（20.3%），總的來(lái)說(shuō)同屬的劍水蚤遺傳距離要比不同屬間的遺傳距離小。
　　總之，DNA條形碼鑒定的結(jié)果和形態(tài)學(xué)結(jié)果是基本上一致的，而且在區(qū)分姊妹種方面要優(yōu)于傳統(tǒng)方法。本研究構(gòu)建我國(guó)內(nèi)陸鹽水浮游動(dòng)物優(yōu)勢(shì)種對(duì)應(yīng)的mtCOI序列數(shù)據(jù)庫(kù)，為我國(guó)內(nèi)陸鹽水浮游動(dòng)物積累些背景數(shù)據(jù)。并在此基礎(chǔ)上，探索物種的遺傳多樣性，并與形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果進(jìn)行對(duì)比，確定用分子生物學(xué)手段來(lái)快速、標(biāo)準(zhǔn)化