分子生物學(xué)中核心概念的語(yǔ)義分析.pdf

1、DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的確立標(biāo)志著生物學(xué)進(jìn)入分子生物學(xué)時(shí)代。分子生物學(xué)的快速發(fā)展使得生物學(xué)成為繼相對(duì)論和量子力學(xué)革命以來(lái)發(fā)展最快、成就最多的學(xué)科之一。分子生物學(xué)理論的巨大成就,對(duì)人類的認(rèn)識(shí)論、思維方式及社會(huì)發(fā)展都產(chǎn)生了很大的影響。因此,對(duì)其核心概念進(jìn)行分析,顯得尤為必要。而在對(duì)這些概念的表征、指稱、意義、真理性、實(shí)在論等問(wèn)題的分析過(guò)程中,語(yǔ)義分析方法作為一種普遍的、具有時(shí)代特征的語(yǔ)義學(xué)方法論,在生物學(xué)哲學(xué)中的運(yùn)用既是無(wú)法避開(kāi)的,也是一種不

2、可忽視的科學(xué)的研究方法。語(yǔ)義分析方法在科學(xué)哲學(xué)中運(yùn)用的“中性”特點(diǎn),使得其對(duì)科學(xué)實(shí)在論等傳統(tǒng)問(wèn)題的研究具有超越性。并且生物學(xué)理論表述的多元化特征使得語(yǔ)義分析方法的應(yīng)用更具有靈活性。因此,本文使用語(yǔ)義分析的方法對(duì)分子生物學(xué)中遺傳的載體——基因、遺傳的機(jī)制——中心法則、遺傳信息以及遺傳的信息——遺傳密碼進(jìn)行了系統(tǒng)的分析。嘗試?yán)迩暹@些概念的本質(zhì),以期對(duì)它們作為科學(xué)概念以及哲學(xué)概念的夯實(shí)與完善都有所意義。但是,需要明確的一點(diǎn)是,對(duì)任何概念的語(yǔ)義

3、分析都無(wú)法離開(kāi)其語(yǔ)形表征的前提,因?yàn)?沒(méi)有語(yǔ)形表征的語(yǔ)義分析是沒(méi)有意義的。而對(duì)任何概念語(yǔ)形表征的分析也都無(wú)法離開(kāi)對(duì)其的語(yǔ)義分析,因?yàn)?沒(méi)有語(yǔ)義分析的語(yǔ)形表征是空洞的。同時(shí),對(duì)每一個(gè)概念語(yǔ)義分析的意義使用又無(wú)法離開(kāi)語(yǔ)用的選擇,即對(duì)每一個(gè)概念的語(yǔ)義分析都不能脫離對(duì)其社會(huì)語(yǔ)境的分析,因?yàn)?脫離了語(yǔ)用分析的語(yǔ)義分析就可能是狹隘的、不可通約的。因此,語(yǔ)形、語(yǔ)義以及語(yǔ)用這三者之間是一個(gè)有機(jī)的語(yǔ)境論的整體,無(wú)法割離。而文章在對(duì)基因、中心法則、遺傳信息

4、以及遺傳密碼這些概念的語(yǔ)義分析過(guò)程中,無(wú)論是自覺(jué)的或者不自覺(jué)的,都是建立在這三者統(tǒng)一的一個(gè)語(yǔ)境論的基礎(chǔ)之上。
　　本論文主要包括緒論、五章的系統(tǒng)論述以及結(jié)束語(yǔ)。其中緒論部分主要介紹了論文的研究目的和意義、國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀以及研究的主要內(nèi)容等。
　　第一章為“分子生物學(xué)中的語(yǔ)義分析”:1.1、首先闡述了在分子生物學(xué)中語(yǔ)義分析興起的背景,其中主要論述了生物學(xué)哲學(xué)興起的背景,以及語(yǔ)義分析方法在科學(xué)哲學(xué)與生物學(xué)哲學(xué)中的應(yīng)用傳統(tǒng);1.2

5、、論述了在分子生物學(xué)哲學(xué)中語(yǔ)義分析的本質(zhì)特征以及意義,表明了分子生物學(xué)哲學(xué)中語(yǔ)義分析的本質(zhì)應(yīng)該是一種語(yǔ)境論的語(yǔ)義分析,并討論了語(yǔ)義分析方法與分子生物學(xué)概念的指稱確定、語(yǔ)義闡釋、形式化構(gòu)建、經(jīng)驗(yàn)性驗(yàn)證、真理性、實(shí)在論等問(wèn)題之間的關(guān)系。
　　第二章為“基因的語(yǔ)義分析”:其中2.1、在語(yǔ)境論的基礎(chǔ)上分三個(gè)階段分析了基因概念的語(yǔ)義變遷——古希臘時(shí)期、19世紀(jì)60年代后顆粒遺傳學(xué)說(shuō)提出到DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)之間、DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)之后至今

6、,表明基因概念的語(yǔ)義變遷是依賴于特定的語(yǔ)境,隱喻的發(fā)生轉(zhuǎn)移;2.2、討論了語(yǔ)境論視野下的基因本質(zhì),主要包括對(duì)大眾科學(xué)下基因概念誤區(qū)的分析、基因概念還原本質(zhì)的分析以及基因概念的語(yǔ)境論解釋;2.3、論述基因理論發(fā)展過(guò)程中的隱喻機(jī)制,闡述了基因理論發(fā)展過(guò)程中的隱喻思維及其方法論功能。
　　第三章為“中心法則的語(yǔ)義分析”:3.1、闡述了中心法則形成的邏輯基礎(chǔ),主要包括理論基礎(chǔ)(時(shí)代背景知識(shí))與社會(huì)基礎(chǔ);3.2、利用語(yǔ)義分析的方法,對(duì)作為科

7、學(xué)理論的中心法則的語(yǔ)義變遷進(jìn)行了分析,并指出這種變遷是在分子生物學(xué)縱向語(yǔ)境的不斷變化中實(shí)現(xiàn)的。只有在特定的語(yǔ)境下對(duì)中心法則進(jìn)行不同層面的語(yǔ)義解釋,才不會(huì)導(dǎo)致其語(yǔ)義的局限性,在中心法則語(yǔ)義變遷的過(guò)程中充分體現(xiàn)了語(yǔ)境論的認(rèn)識(shí)特征;3.3論述了中心法則對(duì)于現(xiàn)代生物學(xué)的哲學(xué)意義以及傳統(tǒng)意義下分別作為科學(xué)理論與作為研究方法的中心法則的意義局限性,表明傳統(tǒng)意義下作為科學(xué)理論的中心法則反映了一種還原論的思維,中心法則為還原論者研究基因組提供了一種方法

8、論上的保障,然而這種自下而上的還原的研究策略帶來(lái)的問(wèn)題是研究的復(fù)雜度驚人;3.4結(jié)合計(jì)算機(jī)模擬,提出了一種自上而下的中心法則新的研究策略,試圖對(duì)上面的困境給出一種解答。
　　第四章為“遺傳信息的語(yǔ)義分析”:4.1、為信息概念的語(yǔ)義溯源,討論了信息概念的產(chǎn)生以及之后對(duì)早期信息概念的挑戰(zhàn)與辯護(hù);4.2、闡述了對(duì)信息概念持否定態(tài)度的學(xué)者對(duì)這一概念的幾個(gè)詰問(wèn);4.3、討論了關(guān)于遺傳信息的討論中最主要的問(wèn)題之一——基因是否具有信息?并表明,

9、我們既不能忽略信息在經(jīng)驗(yàn)事實(shí)上的使用,也不能過(guò)分強(qiáng)調(diào)信息的語(yǔ)義性質(zhì),而應(yīng)該在語(yǔ)境論的基底上對(duì)其進(jìn)行完整的理解;4.4、使用語(yǔ)義上升和語(yǔ)義下降的方法對(duì)信息的概念進(jìn)行了語(yǔ)境論的解釋,并討論了信息概念的部分語(yǔ)義性質(zhì);4.5、討論了基因與非基因系統(tǒng)中信息遺傳的特征。
　　第五章為“遺傳密碼的語(yǔ)義分析”:5.1、為遺傳密碼的語(yǔ)義溯源,從遺傳密碼的提出開(kāi)始,討論了遺傳密碼發(fā)現(xiàn)的邏輯,并闡述了遺傳密碼的語(yǔ)義性質(zhì);5.2、論述了遺傳密碼內(nèi)涵與解釋