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文檔簡介
1、生物大分子在溶液中的結構(二級結構,三級結構四級結構)對于它們的生物功能具有決定作用。NMR(Nuclearmagneticresonance)是在接近生理環(huán)境的溶液中確定生物分子結構和動力學的一種方法,因此廣受關注。目前,生物NMR蓬勃發(fā)展,已成為一個相對獨立的領域,這個領域的主要熱點是用各種NMR方法去闡明蛋白質或脫氧核糖核酸(DNA)等生物大分子的結構和動力學變化。生物NMR研究中,蛋白質結構解析發(fā)展迅速。蛋白質是基因表達的產物及
2、基因功能的實施者,其結構表征與構象的表征對于理解其功能非常重要。本論文主要以一種重要的氧化還原酶-硫氧還蛋白還原酶(Thioredoxinreductase,簡稱TrxR)為對象,通過各種NMR技術和生物學手段來對其基本結構進行表征,以期明確其氧化還原機制。
TrxR是一種NADPH依賴的包含有FAD結構域的二聚體硒酶,屬于吡啶核苷酸——二硫化物氧化還原酶家族體系。它的每個亞基中存在著NADPH區(qū)和FAD區(qū)兩個功能結構域,在生
3、物體內,這兩個區(qū)域在發(fā)揮其生物功能的過程中會發(fā)生結構的動態(tài)旋轉,從而導致其結構的不穩(wěn)定。因此其表達和溶液結構的穩(wěn)定控制困難,是我們研究面臨的主要困難,本論文主要針對以上問題進行了2個方面的研究:
(1)為了明確TrxR的結構變化特征,我們在接近細胞體液的環(huán)境中對硫氧還蛋白進行了核磁共振的探究。為了克服TrxR結構的不穩(wěn)定性對于實驗過程中核磁共振信號的采集造成的困難,我們尋找了一些可以將其結構穩(wěn)定的方法,比如將其中的半胱氨酸進行
4、突變,將兩個結構域切開,在無氧的條件下與還原劑反應等方法,還用了熒光光譜法和圓二色譜法對其結構的變化進行了觀測。進而結合氘代與選擇性標記的方法,采集了一系列基于TROSY的核磁共振二維和三維譜圖,初步得到了一部分氨基酸殘基信號的歸屬。
(2)由于生物樣品溶液中溶劑水的核磁共振信號非常強,對溶質信號的辨別造成一定程度的干擾,因此我們還系統的對一些NMR溶劑抑制技術進行了比較,以便為相關研究提供指導。我們發(fā)現,不同的溶劑峰壓制方法
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