DNA編碼序列檢測的優(yōu)化算法設計.pdf

1、DNA編碼序列的檢測是隨著海量生物基因信息的出現(xiàn)而出現(xiàn)的，利用數(shù)字信號處理快速高效的優(yōu)點，根據(jù)DNA編碼序列的特征設計專門的檢測方法，目前已經(jīng)得到了長足的發(fā)展。
　　 針對傳統(tǒng)編碼序列檢測算法中大多存在的單純依賴周期3特性、補零延拓對幅頻響應能量零貢獻、校正不精確等不足，本文提出了結合堿基含量的雙端周期延拓周期3編碼序列檢測算法，增強了檢測曲線的指示性，進一步提高了檢測算法的準確性和健壯性。
　　 結合DNA編碼區(qū)規(guī)則，

2、本文對檢測結果進行了進一步甄別和優(yōu)化，對數(shù)據(jù)集HMR195進行測試表明：在核苷酸水平檢測結果的ROC指標率達到86.87％，明顯高于當前的處理效果。實驗結果證實該組合算法進一步校正了位置偏移，結合CG含量和編碼區(qū)規(guī)則等先驗信息的方法在不增加時間復雜度的同時，優(yōu)于現(xiàn)存AMDF、TDP等最優(yōu)時、頻域檢測方法。
　　 最后，基于本文提取的編碼序列特征，設計了支持向量機(SVM)分類器。對數(shù)據(jù)集HMR195中的DNA序列進行了核苷酸級別