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文檔簡介
1、基因組DNA序列上起始密碼子鄰近序列中,存在著一些功能保守區(qū),我們在以前的工作中研究了酵母等幾個模式生物基因組中起始密碼子與L-Ter(從起始密碼子上游同相位遇到的第一個終止密碼)之間的平均距離及其距離分布,發(fā)現(xiàn)了一些有意義的結(jié)果.為了更深入的研究這一問題的普遍性,該文在第一部分中,選用了二十一種細(xì)菌,并把它們的全基因組中所有的ORF序列分成已知基因和不確定的ORF兩大類,再按照不同的起始密碼子(ATG、GTG、TTG)對每一類分別分成
2、三種序列;分析計算了每種情況下起始密碼子上游L-Ter到該起始密碼子的距離分布和L-Ter(TAA、TAG、TGA)的相對使用頻率.第二部分中,分析了大腸桿菌基因mRNA在轉(zhuǎn)譯過程中讀碼錯位時,終止密碼子的密度分布與蛋白質(zhì)合成終止的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)錯位時在編碼序列的尾段比首段出現(xiàn)較多的終止密碼子,而首尾兩段都比中間區(qū)段的密度大,說明錯位時在編碼序列的頭和尾部的保守區(qū)域都有較強的使蛋白質(zhì)合成終止的信號.第三部分中,研究了多肽鏈的氨基酸殘基間氫鍵
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