紅根甘肅桃1號抗南方根結線蟲基因的定位與發(fā)掘.pdf

1、根結線蟲(Meloidogyne spp)是影響世界作物安全生產(chǎn)的重要病害，同時也是造成桃樹“短壽病”和“重茬病”的重要致病因素之一，其中尤以南方根結線蟲(Meloidogyne incognita)危害最為廣泛和嚴重。培育抗根結線蟲桃品種是控制南方根結線蟲病害的綠色安全、經(jīng)濟高效措施。對桃抗根結線蟲基因進行全面系統(tǒng)研究，探索抗病基因在免疫系統(tǒng)中的位置和作用，為認識桃抗根結線蟲的本質奠定基礎。本課題組前期圍繞紅根甘肅桃1號(Prunus

2、 kansuensis L)抗南方根結線蟲基因進行了大量的基礎工作研究建立了一種快速鑒定桃對根結線蟲抗性的方法，確定了桃表觀形態(tài)發(fā)生變化的重要時期，利用‘紅根甘肅桃1號’和‘貝蕾’構建了桃連鎖圖譜，將抗根結線蟲基因定位在2號染色體，完成‘紅根甘肅桃1號’和‘貝蕾’南方根結線蟲侵染后各時期的轉錄組測序，用二代分子標記定位紅根甘肅桃1號抗南方根結線蟲基因，將抗性基因定位至NBS29(6cM)和SRAPs標記M4E11-100(20cM)之間

3、。為更精確對紅根甘肅桃1號抗南方根結線蟲基因定位，本研究將繼續(xù)進行該抗性基因的定位和發(fā)掘工作，為抗病品種的利用提供思路，同時為抗病育種工作奠定理論依據(jù)。
　　本研究首先以BC1代構建抗、感基因池進行BSA測序。而后用‘紅根甘肅桃1號’和‘貝蕾’雜交F1自交構建F2代分離群體，利用BSA測序結果以及KASP基因分型確定抗性候選位點區(qū)段，深入分析基因序列以及基因表達量，逐步發(fā)掘控制紅根甘肅桃1號抗南方根結線蟲的關鍵基因。通過以上試驗，

4、本研究初步明確了控制紅根甘肅桃1號抗南方根結線蟲的候選關鍵基因，獲得的主要結果如下
　　1、利用親本為‘紅根甘肅桃1號’和‘貝蕾’的BC1群體構建抗、感混池，以全基因組重測序為基礎進行性狀BSA定位，共檢測到2，442，036個SNPs。篩選親本中純合且F1中雜合的SNP位點，共挑選出1，569，564個多態(tài)性標記。選擇‘紅根甘肅桃1號’作為參考親本，分析計算兩個子代池的△SNP-index。選擇95％置信水平下，在全基因組范圍內(nèi)

5、挑選兩個子代在SNP-index差異顯著的SNP位點，得到候選的77個多態(tài)性標記位點。
　　2、利用15個SNPs對302份F2代材料進行KASP基因分型，共獲得3883個位點的基因型，占總位點數(shù)的857％。獨立性檢驗結果表明SNP3(CHR24905737)、SNP5(CHR25397749)、SNP7(CHR25582276)與紅根甘肅桃1號抗南方根結線蟲基因相關性最高。
　　3、利用不同侵染時期的‘紅根甘肅桃1號’、‘