玉米干種子胚與萌發(fā)胚M(jìn)icroRNA的差異表達(dá)分析.pdf

1、MicroRNA(miRNA)是一類(lèi)內(nèi)源性的、非蛋白編碼的單鏈小RNA。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn)，miRNA在植物的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程，以及響應(yīng)生物脅迫和非生物脅迫中起著非常重要的作用。萌發(fā)對(duì)于植物的生長(zhǎng)非常關(guān)鍵，隨著種子的吸水，能量代謝，細(xì)胞修復(fù)等一系列生命活動(dòng)開(kāi)始恢復(fù)，與此同時(shí)，參與調(diào)控基因表達(dá)的miRNA也開(kāi)始活躍起來(lái)。本研究的目的就是為了更深入的探究miRNA在種子萌發(fā)過(guò)程中所起的關(guān)鍵性作用。
　　 本研究利用Solexa高通量測(cè)序技術(shù)

2、對(duì)玉米干種子和吸漲24h后的胚miRNA文庫(kù)進(jìn)行了深度測(cè)序，結(jié)合生物信息學(xué)的方法對(duì)兩種子胚中miRNA的類(lèi)型、豐度及靶基因進(jìn)行了差異分析，初步探討了差異表達(dá)miRNA在種子萌發(fā)過(guò)程中所起的作用。本研究獲得的主要結(jié)果如下:
　　 1.在這兩種小RNA文庫(kù)中都檢測(cè)到24個(gè)miRNA家族的110個(gè)miRNA，其中16個(gè)家族表現(xiàn)出明顯的表達(dá)差異。miR156，miR159，miR164，miR166，miR167，miR168，miR1

3、69，miR172，miR319，miR393，miR394和miR39712個(gè)miRNA家族在萌發(fā)胚中表達(dá)明顯下調(diào)，而miR398，miR408，miR528和miR5294個(gè)家族表達(dá)顯著上升。
　　 2.對(duì)這兩個(gè)庫(kù)中的新的miRNA及其靶基因進(jìn)行了預(yù)測(cè)，并對(duì)新的miRNA靶基因作了GO分析，結(jié)果顯示在干種子胚中參與碳水化合物代謝的基因比較豐富，而在萌發(fā)胚中涉及到的基因范疇較多，比如與氨基酸合成相關(guān)的基因，與異構(gòu)酶，連接酶活性