2023年全國碩士研究生考試考研英語一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁
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文檔簡介

1、隨著后基因組時(shí)代的到來,生物組學(xué)研究深入發(fā)展,大量的生物網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)涌現(xiàn),有效地解析和分析這些網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)是當(dāng)前生物信息學(xué)的研究重點(diǎn)。網(wǎng)絡(luò)模體是網(wǎng)絡(luò)中一種有著不同局部結(jié)構(gòu)特征的模塊,在生物網(wǎng)絡(luò)中具有重要的作用。大量算法被研究出來用于網(wǎng)絡(luò)模體發(fā)現(xiàn),由于網(wǎng)絡(luò)模體發(fā)現(xiàn)計(jì)算非常復(fù)雜,抽樣算法被用來減少網(wǎng)絡(luò)模體發(fā)現(xiàn)的計(jì)算量,但是抽樣算法不可避免的抽樣誤差影響抽樣結(jié)果的正確性,是抽樣網(wǎng)絡(luò)模體發(fā)現(xiàn)中不可忽視的問題。本文致力于研究具有低抽樣誤差的網(wǎng)絡(luò)模體發(fā)現(xiàn)算

2、法。
   為了降低抽樣誤差,針對現(xiàn)有抽樣網(wǎng)絡(luò)模體發(fā)現(xiàn)算法在計(jì)算子圖比例時(shí)采取同構(gòu)子圖簡單計(jì)數(shù)的方法,本文提出了一種基于子圖擴(kuò)展和子圖支持度的網(wǎng)絡(luò)模體發(fā)現(xiàn)抽樣算法——SE&SSV(Sampling Network Motif Detection Algorithm Basedon Subgraph Extending and Subgraph Support Value)算法。該算法采用子圖擴(kuò)展的方法進(jìn)行同構(gòu)判斷,在擴(kuò)展的過程中

3、計(jì)算出一個衡量子圖同構(gòu)概率的子圖支持度值(Subgraph Support Value,SSV),將子圖支持度(SSV)用到子圖濃度的計(jì)算當(dāng)中,可以考慮到更多的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)湫畔?。?shí)驗(yàn)結(jié)果表明該算法具有較低的抽樣誤差和較高的穩(wěn)定性。
   由于現(xiàn)有抽樣網(wǎng)絡(luò)模體發(fā)現(xiàn)算法中子圖樣本的選取通常采用簡單隨機(jī)抽樣方法,而在相同樣本容量情況下,分層抽樣方法通常比簡單隨機(jī)抽樣具有更小的抽樣誤差,更高的抽樣精度。因此,本文提出一種基于節(jié)點(diǎn)度序列分布特

4、征的網(wǎng)絡(luò)模體發(fā)現(xiàn)分層抽樣算法——SRand_ESU(Stratified Sampling Network MotifDetection Algorithm Based on Vertices Degree Sequence)算法。該算法將輸入網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn)度序列特征作為抽樣分層的指標(biāo),根據(jù)不同的度序列分布特征選擇合理的分層模型,可以有效降低抽樣誤差提高抽樣精度。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該算法取得的子圖樣本節(jié)點(diǎn)度分布與輸入網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)度分布更加一致,并且

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