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文檔簡介
1、MapReduce,一個強大的編程模型,逐漸成為一個廣受歡迎的編程框架。它對于大規(guī)模的數(shù)據(jù)密集型計算是非常高效的。MapReduce編程模型有可能成為HPC(High Performance Computing)環(huán)境中潛在的新方法,而且很多人熱衷于研究其適用性。MapReduce工作負(fù)載可能只占總工作負(fù)載的一小部分,但是它們通常需要自己的獨立的環(huán)境,因此很難在傳統(tǒng)的高性能計算集群中支持。HPC集群通常使用并行文件系統(tǒng),比如IBM GPF
2、S(global parallel file system)或者Lustre。
IBM PlatformLSF(load sharing facility)為HPC環(huán)境提供高級資源管理和高級資源調(diào)度。LSF是一個企業(yè)級軟件,在現(xiàn)存的異構(gòu)IT資源上分配工作,創(chuàng)建一個共享的靈活的具有容錯性的基礎(chǔ)設(shè)施,在提供更快、更可靠的工作負(fù)載性能的同時降低成本。LSF最大限度地發(fā)揮HPC集群的性能優(yōu)勢。HPC高性能計算利用并行處理高效、可靠并快
3、速地運行高級應(yīng)用程序。LSF用戶希望在LSF環(huán)境下提交并運行MapReduce應(yīng)用,因此IBM公司決定啟動該項目,本人有幸參與其中。為了實現(xiàn)MapReduce應(yīng)用在LSF HPC環(huán)境下運行,本文使用了兩種方法。
第一種方法,即LSF基于Hadoop實現(xiàn)MapReduce應(yīng)用,允許用戶提交Hadoop MapReduce工作負(fù)載作為LSF常規(guī)并行作業(yè)且在HPC集群環(huán)境下運行,其中為用戶提供一個腳本,用戶將腳本和MapReduce
4、工作作為LSF作業(yè)請求資源。一旦LSF作業(yè)啟動運行,腳本就會在分配的資源上自動提供一個Hadoop集群,用戶不需要獲得root特權(quán)就可以基于提供的資源在HPC環(huán)境下配置Hadoop集群。由于每個LSF Hadoop作業(yè)擁有自己的資源/集群,因此本方法允許多個用戶共享高性能計算集群資源的公共池。LSF使用blaunch技術(shù)來啟動和監(jiān)控LSF作業(yè)分配的Hadoop集群,以至于可以收集MapReduce工作負(fù)載以及控制整個作業(yè)生命周期。關(guān)于是
5、否使用HDFS管理數(shù)據(jù),本文都進(jìn)行了實驗,同時分別分析并比較了其性能。由于在作業(yè)運行之前需要進(jìn)行Hadoop配置以及啟動守護(hù)進(jìn)程,在作業(yè)運行完成以后要進(jìn)行清理工作,這些都增加了很大的開銷。同時Hadoop集群的故障會直接導(dǎo)致MapReduce任務(wù)的失敗。為了解決第一種方法的不足之處,本文提出了第二種方法
第二種方法是MapReduce作業(yè)直接在LSF HPC環(huán)境中運行。在Hadoop框架中MapReduce與HDFS是緊密耦合
6、的,因此需將其從MapReduce框架中提取出來,通過利用內(nèi)在固有的分布式文件系統(tǒng)的功能,設(shè)計了所需的組件。首先是數(shù)據(jù)管理,其中包括輸入數(shù)據(jù)管理和分布以及輸出數(shù)據(jù)收集;其次是對MapReduce作業(yè)進(jìn)行轉(zhuǎn)換使其適用于HPC環(huán)境下的調(diào)度;最后是關(guān)于任務(wù)并行和同步控制,以及容錯機(jī)制。MapReduce模型不僅體現(xiàn)了適用性同時也具備高性能。此設(shè)計使用了IBM GPFS并行文件系統(tǒng),同時利用了LSF完備的高級資源管理,高級資源調(diào)度以及健壯的容錯
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