基于SVM算法的微小RNA靶標(biāo)預(yù)測研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、STUDYONMIRNATARGETSPREDICTIoNBASEDoNSVMALGo砒THMByHuWenbinADISSERTATIONSubmittedtoNanjingAgriculturalUniversityInPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheMasteralDegreeofEngineeringSupervisor：ProfXuHuanliang&AssociateProf

2、LiangJingdongMajor：ComputerApplicationsDirections：BioinformaticsTimeofThesisDefense：June2012吣5㈣0眥6m哪l眥6叫3洲2洲Y目錄目錄ji目要IABSTRACTIII第一章緒論111微小RNA基因的研究進(jìn)展1111微小RNA研究的興起1112微小RNA的生物學(xué)原理2113微小IⅢA靶基因的研究現(xiàn)狀312生物信息學(xué)中的計(jì)算方法4121Perl與Bi

3、operl5122機(jī)器學(xué)習(xí)與支持向量機(jī)(SVM)613研究意義914研究思路及內(nèi)容915本文結(jié)構(gòu)安排10第二章微小RNA靶標(biāo)預(yù)測研究現(xiàn)狀112。1微小RNA靶標(biāo)配對參考規(guī)則。1l22靶標(biāo)預(yù)測軟件12221miRanda13222TargetScan14223RNA22一14224RNAhybrid1522!；PicTar11；23靶標(biāo)預(yù)測算法小結(jié)15第三章微小RNA相關(guān)數(shù)據(jù)庫及研究數(shù)據(jù)收集l931微小RNA及靶標(biāo)相關(guān)數(shù)據(jù)庫1932數(shù)據(jù)來

4、源l9321微小RNA基因數(shù)據(jù)一19322微小RNA靶標(biāo)數(shù)據(jù)。21323UTR及CDS數(shù)據(jù)2233基因數(shù)據(jù)的獲取及處理23331基因數(shù)據(jù)獲取23332基因數(shù)據(jù)處理26第四章基于SVM的靶標(biāo)預(yù)測算法研究2941靶標(biāo)上下文特征分析29411正負(fù)集數(shù)據(jù)構(gòu)建29412靶標(biāo)基因長度32413靶標(biāo)位置特征33414自由能特征34415堿基含量特征36416靶標(biāo)位點(diǎn)密度特征40417motif特征40418特征選取小結(jié)4642svMicroTar算法

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