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文檔簡介
1、擬南芥PSB27蛋白位于葉綠體類囊體腔中,PSB27蛋白是由核基因At(1)g03600編碼的,其成熟肽區(qū)蛋白分子量為11.7KD。N端的前導肽序列由67個氨基酸殘基組成,幫助PSB27蛋白進入類囊體腔。PSB27對于植物適應可變光強是必不可少的,突變體植株在穩(wěn)定持續(xù)強光或弱光處理時,和野生型的擬南芥表型沒有明顯區(qū)別;但在可變光處理下生長異常,突變體植株十分矮小,該突變體是由于psb27基因缺失導致。鑒于psb27突變體特異性地對變化光
2、敏感,推測PSB27蛋白是植物應對變化光的關(guān)鍵因子之一。我們猜想,可能是類囊體腔內(nèi)環(huán)境的pH隨著光強的改變而改變,蛋白質(zhì)內(nèi)的酸性或堿性氨基酸可能會感應不同的pH;反過來類囊體腔內(nèi)環(huán)境的不同pH也會對PSB27蛋白的結(jié)構(gòu)有影響,因此我們通過X射線衍射出PSB27的晶體結(jié)構(gòu)并對其結(jié)構(gòu)進行分析,在晶體結(jié)構(gòu)的基礎上通過將擬南芥PSB27同位素15N標記的蛋白樣品進一步應用于異核單量子相干(Heteronuclear single quantum
3、 coherence,HSQC)光譜分析。并通過核磁共振(Nuclear Magnetic Resonance,NMR)技術(shù)對處于溶液狀態(tài)中的被15N和13C標記的PSB27蛋白的主鏈和側(cè)鏈進行指認。另外,還通過蛋白序列分析發(fā)現(xiàn),位于α螺旋之間的酸性和堿性氨基酸殘基在植物體中非常特別,這些氨基酸可能會對外界環(huán)境有很強的感應,并改變蛋白結(jié)構(gòu)。所以把它們突變成中性氨基酸并做圓二色譜,分析對結(jié)構(gòu)有何影響。對PSB27蛋白的結(jié)構(gòu)分析將使我們了解
4、植物對光強變化的響應機制,并且對光合作用的研究有重要意義。
本研究主要進行了三方面的研究,取得如下主要結(jié)果:
首先,構(gòu)建pGEX.4T-2-PSB27重組質(zhì)粒,測序正確后用于進行PSB27蛋白的表達及純化,表達的重組蛋白主要以可溶形式存在,用TEV酶切掉融合蛋白中的GST標簽,PSB27蛋白在經(jīng)過分子篩分離、純化后,得到高純度蛋白,濃縮到合適的濃度進行蛋白質(zhì)結(jié)晶試驗,之后送于上海同步輻射光源(SSRF)BL17U的線
5、站做x射線衍射并收集數(shù)據(jù)。我們確定了擬南芥PSB27的晶體結(jié)構(gòu),分辨率為1.85(A)。X射線衍射結(jié)果顯示:PSB27有四個α螺旋:H1(殘基3-22)、H2(殘基30-49)、H3(殘基58-77)和H4(殘基85-104),H2和H3之間具有小α螺旋(殘基52Arg-56Gly,指定為H*),類似于藍藻PSB27的結(jié)構(gòu)。然而,擬南芥PSB27及其藍細菌同源物之間存在幾個結(jié)構(gòu)差異,主要位于N-和C-末端的表面電荷。這些差異表明,高等植
6、物和藍細菌中的PSB27可以在不同的工作機制發(fā)揮作用。
類囊體是一個酸性環(huán)境pH范圍4.5-7.8,為了測試類囊體腔中的pH變化是否影響擬南芥PSB27的構(gòu)象,設置了4個pH4.5、5.5、6.7、7.5通過記錄HSQC光譜分析比較他們在不同的pH下PSB27狀態(tài)是否發(fā)生變化,20℃記15N標記蛋白的HSQC譜圖時,PH為5.5、6.7、7.5的蛋白信號峰狀態(tài)穩(wěn)定且基本無化學位移擾動,而蛋白在pH低于5.5的含有20mM PB
7、S,250mM NaCl,2.5mM DTT和2.5mM Na2EDTA的緩沖液中呈現(xiàn)聚集現(xiàn)象,表明擬南芥PSB27在較低pH環(huán)境中的狀態(tài)是不穩(wěn)定的。擬南芥PSB27蛋白質(zhì)樣品在pH6.7下特別穩(wěn)定,可應用于處于溶液狀態(tài)中的被15N和13C標記的PSB27蛋白的主鏈和側(cè)鏈進行指認。有研究表明,T.elongatus中PSB27位于PSII表面,并通過交聯(lián)方法檢測PSB27-K91與CP43-K381的相互作用。T.elongatus中P
8、SB27的殘基91K92L93K對應于擬南芥PSB27的H4上的86K87R88K殘基。并且T.elongatus中CP43和擬南芥CP43具有81.8%的序列同源性,擬南芥CP43的377LSRLKKDIQPWQERR391類似于T.elongatusCP43中381KNDIQPWQERR391的肽片段,我們合成了擬南芥CP43的377LSRLKKDIQPWQERR391一段氨基酸序列,并使用HSQC滴定方法來測試擬南芥PSB27和C
9、P43的肽片段之間是否有相互作用。然而,擬南芥PSB27的HSQC光譜在加入各種濃度的377LSRLKKDIQPWQERR391的小肽后蛋白信號峰狀態(tài)穩(wěn)定且基本無化學位移擾動,擬南芥PSB27和CP43的這種小肽之間不存在直接相互作用。本實驗小肽片段太短不足以證明兩者之間有相互作用。
最后,構(gòu)建野生型pGEX.4T-3-PSB27重組質(zhì)粒,并以此質(zhì)粒為模板進行PSB27點突變載體構(gòu)建,隨后對PSB27突變體進行蛋白表達及純化,
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