環(huán)江香豬抗腹瀉性狀和產(chǎn)仔數(shù)性狀相關(guān)基因多態(tài)性研究.pdf

1、環(huán)江香豬是廣西著名的地方品種，屬中國(guó)珍稀豬種，2003年通過(guò)國(guó)家原產(chǎn)地地理標(biāo)志注冊(cè)論證。環(huán)江香豬具有產(chǎn)仔數(shù)多、母性好、肉質(zhì)鮮美、抗寒和耐粗飼等優(yōu)良特性，深受養(yǎng)殖戶和消費(fèi)者歡迎。然而，改革開(kāi)放以來(lái)，我國(guó)重視解決溫飽問(wèn)題，養(yǎng)殖業(yè)傾向于飼養(yǎng)體型大、生長(zhǎng)快的豬種，環(huán)江香豬等小型地方品種豬被“打入冷宮”，加之環(huán)江香豬仔豬腹瀉死亡率高，導(dǎo)致環(huán)江香豬的存欄量少，飼養(yǎng)成本高。目前對(duì)環(huán)江香豬相關(guān)功能基因研究鮮有報(bào)道，本研究立足仔豬的抗腹瀉能力和母豬的產(chǎn)仔

2、性狀候選相關(guān)功能基因，包括粘附素13(MUC13)基因、促卵泡激素β亞基(FSHβ)基因、雌激素受體(ESR)基因和合子阻滯因子1(ZAR1)，采用高分辨率熔解曲線(HighResolution Melting，HR)、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)結(jié)合測(cè)序分析的方法進(jìn)行基因多態(tài)性研究，具體結(jié)果如下:
　　1.環(huán)江香豬仔豬腹瀉抗性/易感的MUC13基因的多態(tài)性研究。結(jié)果顯示，環(huán)江香豬MUC13的A、B、C、和D位點(diǎn)有多態(tài)性，分別

3、為SNP A32847G、SNP T37731C、SNP A42824G和SNP G46592C,E位點(diǎn)未檢測(cè)出多態(tài)性。參考報(bào)道中抗性基因型GG型和CC型，統(tǒng)計(jì)154頭環(huán)江香豬的基因型頻率，其中A位點(diǎn)檢測(cè)出的AA和AG基因型頻率分別為0.792和0.208，有利等位基因G頻率為0.104。B位點(diǎn)的CT和TT基因型頻率分別為0.136和0.864，有利等位基因C頻率為0.068。C位點(diǎn)檢測(cè)出的AA、AG和GG三種基因型頻率分別為0.694

4、、0.279和0.027，有利等位基因G頻率為0.166。D位點(diǎn)檢測(cè)出GC和CC基因型頻率分別為0.344和0.656，有利等位基因G頻率為0.172。環(huán)江香豬有利等位基因G與C頻率均較低，這與環(huán)江香豬仔豬斷奶前腹瀉死亡率高的調(diào)研結(jié)果相吻合。進(jìn)一步對(duì)仔豬健康群體、仔豬腹瀉群體和仔豬腹瀉死亡群體ABCD四個(gè)位點(diǎn)基因型研究顯示，四個(gè)位點(diǎn)的不同基因型在三個(gè)分組中分布均存在顯著差別(P＜0.05)，其中C位點(diǎn)差別極顯著(P＜0.01)，說(shuō)明檢測(cè)

5、出的四個(gè)位點(diǎn)的不同基因型與仔豬腹瀉抗性/易感相關(guān)。
　　2.環(huán)江香豬繁殖性狀相關(guān)基因FSHβ、ESR和ZAR1基因的多態(tài)性研究。結(jié)果顯示，首次成功克隆測(cè)序了環(huán)江香豬ZAR1基因的外顯子3，與GenBank中的ZAR1基因(DQ231443，gi:83727928)外顯子3序列100％同源。針對(duì)134頭環(huán)江香豬檢測(cè)樣本中均未發(fā)現(xiàn)FSHβ和ESR基因的多態(tài)突變位點(diǎn)。對(duì)ZAR1基因的外顯子3和部分內(nèi)含子3測(cè)序后發(fā)現(xiàn)5個(gè)新突變SNP位點(diǎn)，