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文檔簡介
1、轉(zhuǎn)化生長因子β1(TGF-β1)是轉(zhuǎn)化生長因子家族的重要成員,具有促進(jìn)細(xì)胞生長、分化、遷移、免疫調(diào)節(jié)和細(xì)胞外間質(zhì)(ECM)形成等作用。本研究以豬TGF-β1基因作為影響豬產(chǎn)仔數(shù)性狀的候選基因,選用大白豬、長白豬、皮特蘭豬、圣特西豬和二花臉豬為實(shí)驗(yàn)材料,利用單核苷酸構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)方法對豬TGF-β1基因進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性的檢測與分析,探討其作為影響豬產(chǎn)仔數(shù)性狀的候選基因的可能性?! ∈紫壤帽緦?shí)驗(yàn)室構(gòu)建的豬BAC文庫TGF-β1
2、陽性克隆測序獲得第2外顯子兩端側(cè)翼序列、第3外顯子3’端、第5外顯子3’端的側(cè)翼序列,對TGF-β1基因cDNA序列和內(nèi)含子4、內(nèi)含子6進(jìn)行了SSCP檢測與分析,發(fā)現(xiàn)5個(gè)SNP:第四內(nèi)含子32處(GenBank序列號:AF461809)C→T突變,第六內(nèi)含子179處G→A突變、1043處C→T突變(GenBank序列號:AJ621785),和3’非翻譯區(qū)2490和2494處GG→AA連鎖突變(GenBank序列號:M23703)。將5個(gè)
3、SNPs做單倍型處理后,群體中主要存在兩種單倍型:CGCAA(記為A),和TATGG(記為K)。對不同豬種的單倍型頻率統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),在大白豬、長白豬、皮特蘭豬和圣特西豬中等引入豬種中,單倍型A為優(yōu)勢等位基因,在中國地方良種二花臉中,單倍型K為優(yōu)勢等位基因。建立線性模型:Y=u+場年季效應(yīng)+TGF-β1單倍型構(gòu)成效應(yīng)+殘差,估計(jì)各單倍型構(gòu)成對大白豬產(chǎn)仔數(shù)的影響效應(yīng)。說明KK型對母豬頭胎總產(chǎn)仔數(shù)有較大的影響。各單倍型構(gòu)成對頭胎產(chǎn)活仔數(shù)和二胎產(chǎn)仔
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