肉牛RXRG和MyoD1基因的克隆、SNPs篩查及其與肉質(zhì)和雙胎性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、西北農(nóng)林科技大學(xué)碩士學(xué)位論文肉牛RXRG和MyoD1基因的克隆、SNPs篩查及其與肉質(zhì)和雙胎性狀的關(guān)聯(lián)分析姓名：黃萌申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：動(dòng)物遺傳育種與繁殖指導(dǎo)教師：昝林森;許尚忠20080501C L O N I N GS N P SD E T E C T I O NO F 兄搬GA N D 腳D ，G E N E SA N D A S S O C I A T I O NA N A L Y S I SB E T W E E NP O

2、 L Y M O R P H I S MA N D M E A T Q U A L I T Y A N D T W I N N I N G T R A I T SI NB E E F C A T T L EA B S T R A C T5 14 b l o o ds 鋤p l e s 矗∞m4 c a t t l e p o p u l a t i o n s —Q i n c h u a I l ，L u X i ，S i I l l

3、 ] m e n t a l ，a n dA n g u sw e r ec o l l e c t e d t o e x t r a c tg e n o m i cD N A ，a I l ds o m e t i s s u e ss 鋤p l e sf ．r o m S i m m e n t a l 、Ⅳe r e切k e nt o e x t r a c t t o t a l R N A i n “ss t u d y

4、．1 1 1 e n t h e i s o l a t i o n ，i d e n t i f i c a t i o n a I l d b i o l o g i ci n f o m a t i o ns e q u e n c e a 1 1 a l y s i st o t h eb o V i n eR 艘G g e n ea I l d 蜘D ，g e n ef o rt h ec D N As e q u e n c

5、 e a n dg e n o m i cs e q u e n c ew a Sp e r f o m e db yh o m o l o g yc l o n i n ga I l d b i o i n f o m a t i c s印p r o a c hc o m b i n e d 謝t he l e c t r o I l i c - P C R t e c l l l l i q u e ，I 汀- P C R a l

6、l dP C R - Ⅺ? L P ．A n d t h e n ，S N P s、析t h i n s o m eg e n o m i c 行a g m e n t so ft h e 帆og e n e 、Ⅳe r ed e t e c t e db ys e q u e n c i n g ．F i n a l l y ，t h ea s s o c i a t i o nb e t 、) ~ ，e e n 彤暇G a n d

7、蚴陽(yáng)D J ，g e n ew i t h s o m eb o V i n e t w i l l l l i n g t r a i t a n d m e a tq u a l i 夠佩t s i n6 p o p u l a t i o n sw e r ei n V e s t i g a t e d ．T h e m a i n r e s u l t sw e r e a sf o l l o 、V s ：1 ．B o v

8、 i n e 兄搬G g e n ec D N A b yR r - P C R ，t h ep r o d u c tw a S c l o n e di nP M D 19 一TV e c t o r ．T h es e q u e n c i n g r e s u hs h o w e dt h a t t h e f h g m e n ts e q u e n c ec o i n c i d e dw i t h t h

9、e p r e d i c t i o n ，Ⅵ血i c h i s 18 1 1 b pl o n g ．T h ea l l a l y s i so f 鋤i n o a c i ds e q u e n c ei n d i c a t e d t h a tc a t t l e 尼妝Gg e n ec o n s i s t e dl0 e x o n s a I l d c o d e d 4 6 3 鋤i r l oa

10、c i d s ．H o m o l o g o u sc o m p a r i s o nw i t 量ls o m e a I l i m a l si n d i c 砷e d t h a tc 砌e 兄妝G c D N A s h a r e d8 9 ．5 ％，9 3 ．4 ％，8 7 ．2 ％，8 3 ．9 ％，8 5 ．2 ％s i m i l 撕鑼i nn u c l e i ca c i d s e q u e n

11、c ew i t hh 啪a n ，p i g ，m a c a c 如m o u s ea I l dr a t t u s ．1 1 l l ec D N A o f 彤泣G g e n ew a sc l o n e d ．冗艦Gc D N A w a sf o u n di nm u s c l et i s s u eb yt h ea 1 1 a l y s i so fi t s e x p r e s s i o ni

12、I lv a r i o u st i s s u e s ．b u td i d n ’tb ef ．o u n di no t l l e rt i s s u e s ．2 ．An e w S N P o fc a t t l e 冗j 儂Gg e n e 彳J 9 4 ，Gw a S d e t e c t e db ys e q u e n c i n ga t 3 ’U T R ．D i 仃．e r e n t g e n

13、o t y p e s 、^ ，e r e d e t e r n l i n e d i n L u x i m o n o t o c o u s c o w s ， L u x i 鉚i 肌i n g c o w s ，S i m m e n t a lc o w s ，A n g u s c o w sa n d S i m m e n t a l ×M o n g o l i a c o w sb yr e s t

14、r i c t i o n 觸g m e n tl e n g mp o l y m o 印h i s m ( P C R - R F L P ) ．T h e V a l u eo f p o l y m o 印h i s mi n f o m l a t i o nc o n t e n ti n d i c a t e dt h a tt h i sw a s a m o d e r a t e p o l y m o 印h i

15、s mi n L u x im o n o t o c o u sc o w §a 1 1 dL u x it w i l l I l i n gc o w s ．T h e貯 t e s t i I l d i c a t e d t h a t t h e p o l y m o 咄i c l o c u s i n L u x i t W i I u l i n g c o w s d i d n o t f i tH

16、砌y - W e i n b e 唱e q u i l i b r i u l l l 妒< O ．0 5 ) ．T l l e 貯t e s t o f 嬲s o c i a t i o n a l a I l a l y s i s b e 帆e e ng e n o t y p i cd i s t r i b u t i o n a J l d 帆i n n i l l g o r m o n o t o c o u s

17、t r a i t i nL u X i c o w ss h o w e dt h a t t h ed i 腩r e n c e 、V a S v e 巧s i g l l i f i c 觚t ( 尸< O ．0 1 ) ．3 ．B a s e d o ng e n e p o o l i n ga n d s e q u e n c i n g ，an e w S N P sw a s f o u n d o nt h e