秦川牛H-FABP、A-FABP和E-FABP基因SNPs及其與部分肉用性狀關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、本試驗(yàn)以隨機(jī)選擇相同飼養(yǎng)條件下的146頭18～20月齡秦川牛閹牛為研究對象，采用PCR-SSCP結(jié)合測序技術(shù)對秦川牛H-FABP基因、A-FABP基因和E-FABP基因部分區(qū)段的遺傳變異進(jìn)行檢測，運(yùn)用SPSS統(tǒng)計程序中的GLM模型分析了其中88頭牛與部分肉用性能指標(biāo)的關(guān)系，旨在探索H-FABP基因、A-FABP基因和E-FABP基因?qū)η卮ㄅ２糠秩庥眯誀畹挠绊?，以期加快秦川肉牛的選育進(jìn)程。研究結(jié)果如下： 1、秦川牛H-FABP基因

2、多態(tài)性及其與肉用性狀之間的關(guān)聯(lián)分析 對秦川牛H-FABP基因全部4個外顯子進(jìn)行了SNPs檢測，結(jié)果只在秦川牛H-FABP基因第1外顯子130bp處檢測到了SNP位點(diǎn)Y=T→C。對該SNP基因座具有不同基因型的個體進(jìn)行肉用性狀指標(biāo)進(jìn)行GLM分析，表明AB型個體的后腿圍、背膘厚、大理石花紋等性狀極顯著高于AA型個體(P<0.01)，AB型個體的胴體胸深和嫩度顯著高于AA型個體(P<0.05)，AB型個體的背膘厚極顯著高于BB型個體(

3、P<0.01)；另外BB型個體的后腿圍、大理石花紋等性狀極顯著高于AA型個體(P<0.01)。說明，秦川牛H-FABP基因第1外顯子上存在SNP位點(diǎn)且與肉用性狀有較強(qiáng)的關(guān)聯(lián)性，揭示H-FABP基因可作為秦川牛部分肉用性狀的候選基因。 2、秦川牛A-FABP基因多態(tài)性及其與肉用性狀之間的關(guān)聯(lián)分析 檢測了秦川牛A-FABP基因的第1內(nèi)含子和第2、3、4外顯子的多態(tài)性，結(jié)果分別在第1內(nèi)含子和第4外顯子上檢測到了SNPs位點(diǎn)，在

4、A-FABP基因2736 bp處(第1內(nèi)含子)發(fā)生了Y=A→T的突變，4272 bp處(第4外顯子)發(fā)生了Y=A→G的突變。第1內(nèi)含子共檢測到了AA、AB和BB 3種基因型，分析表明，AB型個體和BB型個體的背膘厚分別顯著(P<0.05)和極顯著(P<0.01)高于AA型個體；BB型個體大理石花紋、嫩度和系水力均顯著高于AA型個體(P<0.05)，表明該SNP位點(diǎn)B等位基因?yàn)閮?yōu)勢等位基因，與背膘厚、大理石花紋、嫩度和系水力等肉用性狀有較

5、高關(guān)聯(lián)度。在第4外顯子也檢測到了基因型AA、AB和BB 3種基因型。分析表明，AA型個體的背膘厚和大理石花紋都顯著(P<0.05)高于BB型個體；AA型個體的嫩度極顯著高于BB型個體(P<0.01)，表明該SNP位點(diǎn)中A等位基因具有提高背膘厚、大理石花紋和嫩度的遺傳效應(yīng)。從以上研究分析可以看出，在秦川牛A-FABP基因中存在可檢測到的SNP位點(diǎn)，且與背膘厚、大理石花紋、嫩度和系水力等肉用性狀間存在顯著關(guān)聯(lián)，提示A-FABP基因很可能是影

6、響秦川牛部分肉用性狀的主效基因或與其主效基因緊密連鎖。 3、秦川牛E-FABP基因多態(tài)性及其與肉用性狀之間的關(guān)聯(lián)分析 檢測了秦川牛E-FABP基因全部4外顯子的遺傳變異情況。結(jié)果在E-PABP基因2295bp處(第4外顯子)發(fā)生了Y=C→T的突變。經(jīng)SSCP分析共檢測到了AA和AB2種基因型，未發(fā)現(xiàn)BB基因型。其中等位基因A和B的頻率分別為0.94和0.06，多態(tài)信息含量為0.11，屬于低度多態(tài)。分析表明，AA和AB基因