西南地區(qū)本地黃牛及其雜交牛CAST、H-FABP、MyoD1基因部分編碼區(qū)多態(tài)性分析.pdf

1、鈣蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin，CAST)是一種內(nèi)源性的、需Ca2+激活的鈣蛋白酶抑制劑，可抑制肌肉內(nèi)蛋白質(zhì)降解，降低肌細胞生長速度；屠宰后可抑制鈣蛋白酶的活性。研究表明，CAST基因的產(chǎn)物顯著影響肉的嫩度。心臟脂肪酸結(jié)合蛋白(Heart—Fatty Acid Binding Protein，H—FABP)基因的作用是將脂肪酸從細胞膜上運送到脂肪酸氧化和甘油三脂及磷脂的合成位置，H—FABP基因的遺傳變異與肌內(nèi)脂肪(Intra

2、muscular Fat，IMF)含量存在相關(guān)性。生肌決定因子(Myogenic Detemination Gene，MyoD)基因不僅可促使靜止期的肌衛(wèi)星細胞向成肌細胞轉(zhuǎn)化，而且能把許多種類型細胞(如成纖維細胞、脂肪細胞等)轉(zhuǎn)化為成肌細胞，并可促進成肌細胞進一步融和、分化為成熟的肌纖維，在成肌過程中起主導(dǎo)作用。 本研究利用應(yīng)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)—單鏈構(gòu)象多態(tài)性(Polymerase Chain Reaction—SingleStr

3、and Conformation Polymorphism，PCR—SSCP)技術(shù)和克隆測序方法對巴山黃牛、盤江黃牛、重慶山地黃牛、西雜牛、紅雜牛、昭通黃牛的CAST、H—FABP、MyoD1基因多態(tài)性和遺傳效應(yīng)進行研究，以期為牛肉品質(zhì)的分子標(biāo)記輔助選擇提供基礎(chǔ)素材。 在CAST基因引物C1擴增片段中檢測出2種基因型。在引物C2擴增片段中，由148位T→C、第159位C→A和第191位A→G和位于內(nèi)含子中的第42位T→C和第68

4、-70位的插入片段形成多態(tài)，C1為優(yōu)勢基因，六個牛群體中昭通黃牛處于中度多態(tài)，其他群體都是低度多態(tài)。序列比對發(fā)現(xiàn)在第148位點突變使酪氨酸→絲氨酸，第191位A→G引起丙氨酸→蘇氨酸，此位點可以作為肉品質(zhì)的侯選基因進一步研究；引物C3的擴增片段中，由位于外顯子第27位G→A、第124-127位點缺失片段和位于內(nèi)含子第182位G→A、第251位C→G形成多態(tài)，在4個地方群體牛中是F1為優(yōu)勢基因，2個雜交群體中是E1為優(yōu)勢基因，這個可能是人

5、工選擇引起的差異，六個牛群的PIC都處于中度多態(tài)，而且在該位點各個牛群體都處于Hardy—Weinberg平衡。在序列對比中發(fā)現(xiàn)在第27位點突變中G→A，使半胱氨酸→丙氨酸。此位點是否可以作為肉品質(zhì)基因的侯選基因需要進一步研究。 對H—FABP基因引物H1擴增片段進行SSCP只發(fā)現(xiàn)單一條帶，說明沒有多態(tài)性。在引物H2擴增片段中出現(xiàn)3個等位基因，但只有3種基因型，此位點多態(tài)信息含量(PolymorphismInformation