MyoD1基因與豬肉質(zhì)性狀相關(guān)性分析.pdf

1、肌分化基因(MyoD1)對(duì)豬的生長(zhǎng)和肌肉的產(chǎn)生起著關(guān)鍵的作用,可使許多類型的細(xì)胞(如成纖維細(xì)胞、脂肪細(xì)胞等)轉(zhuǎn)化為成肌細(xì)胞并分化為成熟的肌纖維。目前在國(guó)內(nèi)還未見關(guān)于豬的MyoD1基因外顯子1的突變位點(diǎn)的報(bào)道,國(guó)外鮮有報(bào)道。分析MyoD1基因結(jié)構(gòu),研究該基因的變異,探討變異位點(diǎn)與豬肉質(zhì)性狀的關(guān)系,可為豬的肉質(zhì)改良提供分子基礎(chǔ)。
　　 隨機(jī)選擇140頭杜×長(zhǎng)×大三元商品雜交豬屠宰。常規(guī)方法測(cè)定滴水損失、pH、肉色、大理石花紋、剪切力

2、、肌內(nèi)脂肪含量;運(yùn)用Bioedit、BLAST、SMART、ProtParam、SOPMA等軟件和在線工具,對(duì)豬MyoD1基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析。采用PCR-SSCP技術(shù)分析MoyD1基因第1外顯子的單核苷酸多態(tài)性,一般線性模型分析基因型與豬肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)性。顯微鏡觀察肌肉石蠟切片并測(cè)定肌纖維的密度、直徑、面積、長(zhǎng)徑、短徑和長(zhǎng)短徑比,分析肌肉組織學(xué)特性與肉質(zhì)性狀的關(guān)系。
　　 所構(gòu)建不同物種的聚類圖顯示豬與牛羊的MyoD1基因結(jié)

3、構(gòu)最為相似:MyoD1基因存在較強(qiáng)的密碼子偏愛性;MyoD1蛋白由BASIC(堿性)結(jié)構(gòu)、HLH結(jié)構(gòu)域和Pfam:Myf5結(jié)構(gòu)域和由2個(gè)低復(fù)雜度區(qū)域(LCR)組成;該二級(jí)結(jié)構(gòu)主要由無規(guī)則卷曲和α螺旋構(gòu)成,在該蛋白上沒有發(fā)現(xiàn)合適的信號(hào)肽;磷酸化位點(diǎn)主要發(fā)生在Ser、Thr和Tyr上。在MyoD1基因5'UTR的119 bp處發(fā)現(xiàn)G＞A的突變,在其第1外顯子387 bp處發(fā)現(xiàn)C＞T突變,經(jīng)檢測(cè)這2個(gè)突變均為AA和AB基因型,2個(gè)變異位點(diǎn)在群

4、體中都是AA型為優(yōu)勢(shì)基因型,各位點(diǎn)基因頻率均符合Hardy-Weinberg平衡。在5'UTR上的突變對(duì)豬肌肉的肌內(nèi)脂肪含量和pH呈顯著影響(p＜0.05),而在第1外顯子上突變對(duì)本試驗(yàn)所研究的肉質(zhì)性狀影響均不顯著(p＞0.05)。對(duì)肌纖維特性進(jìn)行相關(guān)分析結(jié)果顯示,密度與剪切力和大理石花紋呈負(fù)相關(guān)(p＜0.05),直徑和短徑與大理石花紋呈正相關(guān)(p＜0.05)。
　　 結(jié)果表明,在MyoD1基因的5’UTR上的G＞A突變對(duì)豬肌肉