低氧誘導(dǎo)因子-1α(HIF-1α)基因與豬肉質(zhì)性狀的相關(guān)分析.pdf

1、低氧誘導(dǎo)因子-1(Hypoxia-inducible factor-1,HIF-1)是低氧狀態(tài)下產(chǎn)生的一種DNA結(jié)合蛋白,與低氧反應(yīng)元件(HRE)結(jié)合,誘導(dǎo)糖酵解代謝關(guān)鍵酶等轉(zhuǎn)錄增加,使機(jī)體適應(yīng)低氧環(huán)境。目前關(guān)于HIF-1α基因的研究主要集中在人類的疾病、適應(yīng)高原環(huán)境以及低氧訓(xùn)練效果等方面,尚未有人將此基因的功能擴(kuò)展應(yīng)用到受糖酵解影響的肉質(zhì)中。研究HUF-1α基因與肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)性,可為進(jìn)一步認(rèn)識HIF-1α基因的功能,為肉質(zhì)選育開展分子標(biāo)

2、記輔助選擇提供理論依據(jù)。
　　 隨機(jī)選擇209頭杜×長×大三元商品雜交豬屠宰,常規(guī)方法測定滴水損失、pH值、肉色、大理石花紋、剪切力、肌內(nèi)脂肪含量等指標(biāo)。運(yùn)用Biocdit、BLAST、ProtParam、NetPhos2.0 Server等軟件和在線工具,對包括豬物種在內(nèi)的10個(gè)物種HIF-1α基因12外顯子進(jìn)行生物信息學(xué)分析;采用PCR-SSCP技術(shù)篩選豬HIF-1α基因SNPs,一般線性模型分析突變位點(diǎn)基因型與豬肉質(zhì)性狀的

3、關(guān)系,并對測定的性狀進(jìn)行相關(guān)分析;運(yùn)用qRT-PCR方法檢測該基因在前、后腿和背最長肌的表達(dá)豐度,使用方差分析和相關(guān)分析法分析相對表達(dá)量與肉質(zhì)的關(guān)系。
　　 結(jié)果顯示,HIF-1α基因12外顯子425bp的序列在10個(gè)物種中篩查到130個(gè)多態(tài)位點(diǎn),豬的平均核苷酸差異數(shù)目最大。豬的G1927A位點(diǎn)突變,導(dǎo)致丙氨酸變?yōu)樘K氨酸,經(jīng)軟件預(yù)測突變產(chǎn)生的蘇氨酸有可能成為一個(gè)新的磷酸化位點(diǎn)。在該基因部分序列中篩選出3個(gè)突變位點(diǎn),各位點(diǎn)等位基因

4、頻率均符合Hardy-Weinberg平衡。A543T位點(diǎn)多態(tài)對肉質(zhì)性狀沒有顯著性影響(P＞0.05),G1141T位點(diǎn)突變?yōu)殡[性突變,突變型剪切力顯著低于野生型(P＜0.05),1927位點(diǎn)突變?yōu)镚-A堿基轉(zhuǎn)換,其雜合型pH1值顯著低于野生型,而肌內(nèi)脂肪含量顯著高于野生型。該基因的三個(gè)位點(diǎn)在對剪切力、pn值及肌內(nèi)脂肪含量的影響上存在互作。且性狀間存在一定的相關(guān)。RT-PCR結(jié)果顯示HIF-1α基因在前腿肉、背最長肌和后腿肉中均有表達(dá),