牛GlyCAM1基因的多態(tài)性與乳腺炎關(guān)聯(lián)性分析.pdf

1、本實(shí)驗(yàn)以319頭中國(guó)荷斯坦牛、68頭魯西黃牛及40頭渤海黑牛為研究對(duì)象，利用PCR-SSCP、CRS-PCR以及DNA測(cè)序技術(shù)檢測(cè)了GlyCAM1基因的遺傳多態(tài)，并采用最小二乘法擬合線性模型將各基因座不同基因型與奶牛乳腺炎進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果表明:
　　 1、本研究首次發(fā)現(xiàn)牛GlyCAM1基因存在5個(gè)新SNP，分別為5'UNT第602位點(diǎn)存在T/A突變，內(nèi)含子1第1489位點(diǎn)存在C/G突變、在內(nèi)含子2第2239位點(diǎn)存在T/G突變

2、、在外顯子3第3095位點(diǎn)存在A/C突變、在內(nèi)含子3第3431位點(diǎn)存在C/T突變。
　　 2、采用DraⅠ、HindⅢ、MspⅠ、Hin1Ⅱ和Tru1Ⅰ酶切方法檢測(cè)五個(gè)位點(diǎn)等位基因的多態(tài)性。結(jié)果顯示，中國(guó)荷斯坦牛群體中五個(gè)位點(diǎn)的優(yōu)勢(shì)基因型為AA、優(yōu)勢(shì)等位基因?yàn)锳。魯西黃牛及渤海黑牛3095位點(diǎn)的優(yōu)勢(shì)基因型均為AB，優(yōu)勢(shì)等位基因分別為A、B;3431位點(diǎn)優(yōu)勢(shì)基因型均為AA，優(yōu)勢(shì)基因均為A，中國(guó)荷斯坦牛和魯西黃牛在此位點(diǎn)未檢測(cè)到BB

3、基因型。
　　 3、經(jīng)x2適合性檢驗(yàn)，中國(guó)荷斯坦牛5個(gè)SNP位點(diǎn)僅3095位點(diǎn)基因座未達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)。魯西黃牛和渤海黑牛在3095和3431兩位點(diǎn)基因座位均達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＜0.05)。
　　 4、采用最小二乘法擬合線性模型將該基因座不同基因型與奶牛乳腺炎進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果表明胎次效應(yīng)、場(chǎng)效應(yīng)和泌乳月效應(yīng)對(duì)乳腺炎的影響較大(P＜0.01)。602位點(diǎn)