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文檔簡介
1、趨化因子是能使細胞發(fā)生趨化運動的小分子細胞因子,趨化因子白介素-8被驗證具有誘導中性粒細胞遷移等能力,其兩受體α(IL8R-α,即CXCR1)和β(IL8R-β,即CXCR2)通過與趨化因子相結合并借助信號轉導來實現(xiàn)介導中性粒細胞和淋巴細胞在炎癥部位聚集,修復組織損傷等功能,目前兩基因已被列入抗乳腺炎的候選基因。
本研究通過采用DNA測序、巢氏PCR和CRS-PCR方法,對中國荷斯坦牛、魯西黃牛、渤海黑牛的趨化因子受體基因
2、CXCR1的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)進行研究,結果在CXCR1基因第二外顯子發(fā)現(xiàn)了4個SNPs,分別為291(C/T)、333(C/T)、337(A/G)和365(C/T),其中337(A/G)位點和365(C/T)位點的堿基突變引起相應位置氨基酸發(fā)生改變.337(A/G)位點突變引起異亮氨酸轉變?yōu)槔i氨酸,365(C/T)位點突變引發(fā)丙氨酸轉變?yōu)槔i氨酸。
群體遺傳多態(tài)性檢驗發(fā)現(xiàn),291(C/T)、333(C/T)、337
3、(A/G)和365(C/T)位點在中國荷斯坦牛、魯西黃牛、渤海黑牛群體均達到中度多態(tài)(0.25<PIC<0.5),群體遺傳多態(tài)信息含量分布較為平均,4突變位點優(yōu)勢等位基因分別為C、C、A、C,等位基因頻率分別為0.82/0.67/0.65、0.80/0.74/0.71、0.63/0.76/0.63、0.70/0.65/0.82、0.56/0.58/0.56。經(jīng)x2適合性檢驗.渤海黑牛所有位點全部達到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(
4、P>0.05);荷新坦牛在突變位點291(C/T)、333(C/T)和337(A/G)達到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05):魯西黃牛僅在365(C/T)位點達到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05),說明該位點較受外界引種和突變等影響,群體尚待進一步穩(wěn)定。
研究中國荷斯坦奶牛CXCR1基因多態(tài)性(SNP)與奶牛乳腺炎性狀的關聯(lián)性,使用Phase軟件進行單倍型組合預測,構建出15種單倍型和2
5、0種單倍型組合。通過單位點基因型與乳腺性狀關聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn),291(C/T)和333(C/T)突變不存在顯著相關的平均值;337(A/G)突變位點基因型個體在乳脂率、乳蛋白率及產(chǎn)奶量分析上存在顯著相關(P<0.05)的平均值;365(C/T)突變位點基因型個體在乳脂率分析上存在顯著相關(P<0.05)的平均值。通過單倍型組合與乳腺炎的關聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn)在體細胞評分、305天產(chǎn)奶量、乳蛋白率、乳脂量和乳蛋白量5項測試指標中,基因型組合個體之間均
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