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文檔簡介
1、目的:本研究皆在探討人磷脂酶Cεl(Phospholipase C epsilon-1,PLCE1)基因rs2274223(A/G)、rs17417407(G/T)兩位點的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide ploymorphisms,SNP)與結直腸癌(Colorectal Cancer,CRC)的關聯(lián)關系,為結直腸癌高危人群篩查預警,早期診治及個體化預防等策略提供一定的遺傳學依據(jù)。
方法:通過病例-對照研究
2、方法收集2012年2月-2015年2月間就診于我院的240例CRC患者的病例資料(其中直腸癌138例,結腸癌102例),并作為病例組,同時收集同期就診于我院和147例健康人群資料,作為對照組;記錄所有研究對象的年齡、性別、吸煙史、飲酒史及腫瘤家族史等信息;通過蛋白酶K法提取研究對象白細胞中的DNA,采用PCR-LDR法對樣本基因rs2274223(A/G)、rs17417407(G/T)兩位點進行基因型及等位基因分析,分別比較兩個SNP
3、位點不同等位基因及基因分型與CRC關聯(lián)關系。
應用SPSS17.0軟件對實驗數(shù)據(jù)進行處理,采用x2對兩組研究對象進行Hardy-Weinberg均衡性檢驗,以確定病例組與對照組之間有無選擇性差異。采用x2檢驗及t檢驗對兩組研究對象的人口學資料進行統(tǒng)計分析,采用x2檢驗對兩組之間的基因型和等位基因型分布分別進行比較分析,采用EH軟件和2LD軟件對兩組研究對象進行單體型頻率和連鎖不平衡分析。應用非條件Logistic回歸法計算表示
4、相對風險度的比值比(odds ratio,OR)及95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)。檢驗顯著性水準取a=0.05,P<0.05有統(tǒng)計學意義。
結果:
1、PLCE1基因rs2274223(A/G)等位基因有(AA、AG、GG)三種分型,rs17417407(G/T)等位基因有GG、GT、TT三種分型。對照組中兩個位點的基因型頻率分布都符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。
5、
2、PLCE1基因rs2274223(A/G)位點多態(tài)性與直腸癌關聯(lián)關系
PLCE1基因rs2274223位點上等位基因A和G在直腸癌組中出現(xiàn)頻率為68.12%和31.88%,對照組中為78.57%和21.43%,兩組分別相比,認為直腸癌和對照組的差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。在直腸癌組中A/A、A/G、G/G和AG+GG基因型出現(xiàn)的頻率分別49.28%、36.23%、14.49%和50.72%,在正常對照組中
6、分別為61.90%、33.33%、4.76%和38.10%,病例組與對照組中GG、AG+GG基因型分別與AA基因型相比較,差異均有統(tǒng)計學意義(P分別為0.003、0.032)。攜帶GG、AG+GG基因型與直腸癌的發(fā)生有相關性(OR=3.824,95%CI=1.529-9.559; OR=1.673,95%CI=1.044-2.680)。
3、PLCE1基因rs17417407(G/T)位點多態(tài)性與直腸癌關聯(lián)關系:
P
7、LCE1基因rs17417407(G/T)位點上等位基因G和T在直腸癌組中出現(xiàn)頻率為81.52%和18.48%,在正常對照組中為79.59%和20.41%,表明在直腸癌與對照組的對比中,差別無統(tǒng)計學意義(P>0.05);在直腸癌中GG、GT、TT、GT+TT基因型頻率為69.57%、23.91%、6.52%、30.43%,對照組為64.63%、29.93%、5.44%、35.37%,病例組與對照組中TT、GT+TT基因型分別與GG基因型
8、相比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
4、PLCE1基因rs2274223(A/G)位點多態(tài)性與結腸癌關聯(lián)關系
PLCE1基因rs2274223 A和G等位基因在對照組中為78.57%和21.43%,結腸癌組中的頻率70.10%和29.90%,兩組相比較,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。在結腸癌組中基因型A/A、A/G、G/G和AG+GG的頻率為:49.02%、42.16%、8.82%和50.98%,在對照
9、組中為:61.90%、33.33%、4.76%和38.10%,病例組與對照組中AG+GG基因型分別與AA基因型相比較,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。攜帶AG+GG基因型與結腸癌的發(fā)生有相關性(OR=1.690,95%CI=1.013-2.818)。
5、PLCE1基因rs17417407(G/T)位點多態(tài)性與結腸癌關聯(lián)關系
PLCE1基因rs17417407(G/T)位點上等位基因G和T在結腸癌組中出現(xiàn)頻率為76
10、.47%和23.53%,在正常對照組中為79.59%和20.41%,表明在結腸癌與對照組的對比中,差別無統(tǒng)計學意義(P>0.05);在結腸癌中GG、GT、TT、GT+TT基因型出現(xiàn)的頻率分別為62.75%、27.45%、9.80%、37.25%,在正常對照組中則為64.63%、29.93%、5.44%、35.37%,病例組與對照組中TT、GT+TT基因型分別與GG基因型相比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05),
6、PLCE
11、1基因rs2274223(A/G)和rs17417407(G/T)兩SNP s位點聯(lián)合分析
采用EH軟件和2LD軟件對直腸癌組和結腸癌組分別與對照組中PLCE1基因rs2274223(A/G)和rs17417407(G/T)兩SNP s位點進行聯(lián)合分析。顯示PLCE1基因兩SNP s位點在直腸癌組與對照組之間存在著連鎖不平衡(D'=0.119),人群中單體型rs2274223 G-rs17417407T增加直腸癌的發(fā)病風險(O
12、R=2.413,95%CI=1.279~3.819);單體型rs2274223G-rs17417407G增加結腸癌的發(fā)病風險(OR=1.130,95%CI=1.052~2.425),而rs2274223 G-rs17417407T單體型降低結腸癌的發(fā)病風險(OR=0.837,95%CI=0.536~0.934)。其他單體型與CRC的發(fā)病風險可能無關。
結論:
1、PLCE1基因rs2274223(A/G) SNP可能
13、與CRC的發(fā)病風險相關,攜帶AG+GG基因型增加了CRC的發(fā)生風險;攜帶等位基因G可能是中國北方人CRC發(fā)病的一個易感基因標志。
2、PLCE1基因rs17417407(G/T) SNP與CRC的發(fā)病風險無關。
3、PLCE1基因兩SNPs位點在直腸癌組和結腸癌組均與對照組之間連鎖不平衡(D'=0.119),人群中單體型rs2274223G-rs17417407T增加了直腸癌個體的發(fā)病風險;rs2274223G-rs
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