基于隱馬爾可夫模型的多序列比對算法.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文結合生物遺傳與進化的規(guī)律，設計了一種訓練隱馬爾可夫模型的遺傳算法。根據(jù)基因比對的需要和HMM的結構，定義了三種遺傳操作和編碼方式。為了檢驗算法的有效性，用20個原核5sRNA和100條水稻mRNA序列作訓練集對模型進行訓練，然后用訓練好的模型再對訓練序列進行比對，并將該算法在Matlab軟件上編程實現(xiàn)。最后將實驗結果與用B-W訓練HMM進行比對的結果進行了多方面的比較。從比較的結果看，遺傳訓練出的HMM模型對產(chǎn)生20條序列的概率對數(shù)

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