苧麻纖維細(xì)度關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、本研究利用93對(duì)多態(tài)性SSR引物對(duì)104份苧麻核心種質(zhì)進(jìn)行全基因組多態(tài)性位點(diǎn)掃描，在其三季麻混合樣纖維細(xì)度得到精細(xì)測(cè)量的基礎(chǔ)上，對(duì)苧麻的群體結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析，同時(shí)利用關(guān)聯(lián)分析的方法，獲得了與纖維細(xì)度顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)，為今后篩選優(yōu)良種質(zhì)、基因定位和克隆以及分子標(biāo)記輔助育種打下基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:
　　1.利用93對(duì)SSR引物在104份苧麻核心種質(zhì)中擴(kuò)增出255個(gè)位點(diǎn)，多態(tài)性很高，這104份核心種質(zhì)遺傳多樣性豐富;
　　2.根據(jù)基于遺

2、傳相似系數(shù)的UPGMA聚類(lèi)法、PCA主坐標(biāo)分析法和Structure軟件的后驗(yàn)概率對(duì)數(shù)模型的群體結(jié)構(gòu)分析法對(duì)群體分層分析發(fā)現(xiàn)，104個(gè)苧麻核心種質(zhì)分為明顯的兩大類(lèi)，而又可細(xì)分為6個(gè)亞類(lèi);
　　3.試驗(yàn)共得到93個(gè)標(biāo)記的4278個(gè)組合，當(dāng)P＜0.05時(shí)，348個(gè)位點(diǎn)組合處于LD，占總位點(diǎn)組合數(shù)的8.13％;當(dāng)P＜0.01時(shí)，僅102個(gè)位點(diǎn)處于LD，占總位點(diǎn)組合數(shù)的2.4％;按R2的范圍，R2＞0.01的位點(diǎn)組合有2583個(gè)，占總位點(diǎn)

3、組合數(shù)的60.4％;R2＞0.05的位點(diǎn)組合有127個(gè)，占總位點(diǎn)組合數(shù)的3.0％;R2＞0.1的位點(diǎn)組合有11個(gè)，占總位點(diǎn)組合數(shù)的0.25％;
　　4.本研究通過(guò)K=2和K=6的Q+K+MLM和PCA+K+MLM分析模型共同定位消除假陽(yáng)性關(guān)聯(lián)，在P＜0.05的顯著性水平，最終得到了RAM0298、b38和b64等3個(gè)與纖維細(xì)度顯著相關(guān)的分子標(biāo)記。并且3個(gè)關(guān)聯(lián)標(biāo)記對(duì)表型變異解釋率都在5％以上，其中RAM0298在3個(gè)分析模型中對(duì)表型