華南漢族人群中MAFB、IRF6、8q24和10q25多態(tài)性與非綜合征性唇腭裂的關(guān)聯(lián).pdf

1、背景與目的
　　非綜合征性唇腭裂(Nonsyndromiccleftlipwithorwithoutcleftpalate,NSCL/P)是人類最常見(jiàn)的先天性畸形之一,是一種多基因遺傳和環(huán)境因素相互作用的遺傳疾病,其發(fā)病機(jī)制尚未完全明確。本研究的目的是研究中國(guó)華南地區(qū)漢族人群MAFB基因、IRF6基因以及染色體8q24和10q25上的6個(gè)單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)與NSC

2、L/P的關(guān)聯(lián),探討其在NSCL/P的發(fā)病機(jī)制中的作用。
　　材料與方法
　　本研究收集了431個(gè)NSCL/P患者和451個(gè)對(duì)照者。通過(guò)采用TaqMan基因型鑒定技術(shù)對(duì)MAFB(rs17820943、rs6102085和rs6072081)以及IRF6rs10863790,還有分別位于染色體8q24rs987525和10q25rs7078160共6個(gè)SNPs進(jìn)行基因型鑒定。應(yīng)用卡方檢驗(yàn)評(píng)價(jià)這6個(gè)SNPs的基因型頻率和等位基因頻

3、率在NSCL/P患者和對(duì)照者中的分布,并且評(píng)價(jià)其與NSCL/P的關(guān)聯(lián)。
　　結(jié)果
　　MAFBSNPsrs6072081、rs17820943和rs6102085以及IRF6SNPrs10863790與NSCL/P的發(fā)病有顯著關(guān)聯(lián)。
　　1.NSCL/P患者中MAFBrs6072081的A等位基因和AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P值分別是0.001和0.004),rs17820943的C等位基因和CC基因型頻率與對(duì)照

4、組相比增高(P值分別是0.001和0.002),rs6102085的A等位基因頻率和AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P值分別是1.22×10-6和1.27×10-5);NSCL/P患者中IRF6rs10863790的AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P=0.007)。10q25rs7078160和8q24rs987525這2個(gè)SNPs與中國(guó)華南地區(qū)漢族人群NSCL/P之間未發(fā)現(xiàn)有關(guān)聯(lián)。
　　2.唇裂伴腭裂患者中MAFBrs60720

5、81的A等位基因和AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P值分別是4.52×10-4和0.002),rs17820943的C等位基因和CC基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P值分別是6.69×10-5和2.43×10-4),rs6102085的A等位基因和AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P值分別是0.009和8.37×10-7);唇裂伴腭裂患者中IRF6rs10863790的AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P=0.006)。單純唇裂患者中IRF6r

6、s10863790的A等位基因和AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P值分別是0.024和0.017);MAFB這3個(gè)SNPs與單純唇裂和單純腭裂無(wú)關(guān)聯(lián),IRF6rs10863790與單純腭裂無(wú)關(guān)聯(lián)。
　　3.NSCL/P女性患者中MAFBrs6072081的A等位基因頻率和AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P值分別是0.016和0.041),rs17820943的C等位基因頻率和CC基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P值分別是0.018和0

7、.045),rs6102085的A等位基因頻率和AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P值分別是0.032和0.046),男性患者中MAFBrs17820943的C等位基因頻率與對(duì)照組相比增高(P=0.048),rs6102085的A等位基因頻率和AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P值分別是5.64×10-5和1.15×10-41.15×10-4),rs6072081的A等位基因頻率與對(duì)照組相比增高(P=0.069),MAFBrs6072081

8、、rs17820943和rs6102085在男性患者與女性患者中比較無(wú)差別(P值分別是0.626,0.859和0.211);NSCL/P男性患者中IRF6rs10863790的AA基因型頻率與對(duì)照組相比增高(P=0.023),女性患者中IRF6rs10863790的AA基因型頻率與對(duì)照組相比無(wú)顯著差異(P=0.185),男性患者中IRF6rs10863790的A等位基因頻率與女性患者相比增高(P=0.034)。
　　4.NSCL/

9、P患者中MAFBSNPs(rs6072081-rs17820943-rs6102085)ACA單倍體型頻率與對(duì)照組相比增高(P=1.623×10-6),GTG和ACG單倍體型頻率對(duì)照組較高(P值分別是0.0015和0.0215)。
　　結(jié)論
　　在本研究的中國(guó)華南地區(qū)漢族人群中,我們發(fā)現(xiàn)MAFB和IRF6的SNPs與NSCL/P的危險(xiǎn)性有關(guān),并且在不同亞型和性別中可能存在不同影響。
　　1.MAFBrs6072081的

10、A等位基因、rs17820943的C等位基因、rs6102085的A等位基因和IRF6rs10863790的A等位基因與NSCL/P有關(guān)聯(lián)。
　　2.MAFBrs6072081、rs17820943和rs6102085與唇裂伴腭裂有關(guān)聯(lián),與單純唇裂和單純腭裂無(wú)關(guān)聯(lián);IRF6rs10863790與單純唇裂及唇裂伴腭裂有關(guān)聯(lián)。
　　3.MAFBrs17820943和rs6102085在NSCL/P中無(wú)性別差異,在男性和女性中有關(guān)