基于糯玉米高世代群體的SNP標(biāo)記開(kāi)發(fā)及其與淀粉性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、DevelopmentofSNPMarkersinMultipleContinuousBackcrosSPopulationandAssociationAnalysiSofSNPMar’kerswithStarchCharacters(躉ngdaoAgriculturalUniversityInFulfillmentoftheRequirementfortheDegreeof—MasterofScienceZhangShasha(Col

2、legeofLifeScience)Supervisor：SongXiyunQingdaoChinaJune，2013青島農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士論文摘要基于糯玉米高世代群體的SNP標(biāo)記開(kāi)發(fā)及其與淀粉性狀的關(guān)聯(lián)分析摘要本實(shí)驗(yàn)通過(guò)對(duì)多年來(lái)構(gòu)建成功的糯玉米高世代群體(H21BC5F2)進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性(SNP)及遺傳突變與表型之間的相關(guān)性進(jìn)行分析，建立基于單核苷酸多態(tài)性的高支鏈淀粉糯玉米優(yōu)良種質(zhì)快速高效篩選的輔助育種技術(shù)體系，確定與淀粉合成相關(guān)基因的

3、全長(zhǎng)序列，分析目標(biāo)基因在親本與后代、糯與普通玉米序列間的異同點(diǎn)，并進(jìn)行性狀與基因間的關(guān)聯(lián)分析，闡明主效基因?qū)τ衩卓偟矸?、直、支淀粉合成等方面的調(diào)控機(jī)理。1本實(shí)驗(yàn)針對(duì)玉米淀粉合成相關(guān)的基因aesh2，bt2，“dul，sul，WX，sus]分別設(shè)計(jì)了94對(duì)引物，提取玉米自交系H21和紫糯96619的基因組DNA后進(jìn)行PCR擴(kuò)增，擴(kuò)增片段測(cè)序并拼接出候選基因的全長(zhǎng)序列。其中ae基因的全長(zhǎng)為19797bp，sh2基因的全長(zhǎng)為8413bp，bt

4、2基因的全長(zhǎng)為5964bp，du『基因的全長(zhǎng)為11461bpWX基因的全長(zhǎng)為3249bp，sul基因的全長(zhǎng)為8450bp，susl基因的全長(zhǎng)為8726bp。2針對(duì)susl基因進(jìn)行親本之間的序列比對(duì)，找到了120個(gè)SNP位點(diǎn)(包含外顯子與內(nèi)含子)，綜合其翻譯出的氨基酸序列的差異在SNP附近設(shè)計(jì)引物，用于擴(kuò)增H21BCsF2中的目的片段，通過(guò)RotorGeneQ(QIAGEN)高分辨率熔解曲線(xiàn)(HRM)，對(duì)高世代回交群體各個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行分