基于DNA Barcodes和數(shù)量分類學(xué)對(duì)北方耐寒杜鵑資源的分類鑒定和遺傳多樣性分析.pdf_第1頁(yè)
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1、DNA條形碼(DNA barcoding)是利用基因組中一段公認(rèn)的標(biāo)準(zhǔn)的、相對(duì)較短的DN A片段來(lái)對(duì)物種進(jìn)行鑒定,根據(jù)該片段具有足夠的種間變異、而種內(nèi)變異相對(duì)穩(wěn)定而創(chuàng)建的一種新的生物身份識(shí)別系統(tǒng)。數(shù)量分類學(xué)是在20世紀(jì)50年代末期創(chuàng)立的一門學(xué)科,是一種客觀的、量化的、直觀的探討植物類群間親緣關(guān)系的現(xiàn)代方法。為了明確我國(guó)北方耐寒杜鵑資源的系統(tǒng)分類,同時(shí)探討杜鵑屬( Rhododend ron)內(nèi)各亞屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,本研究對(duì)北方耐寒杜鵑資

2、源4亞屬6種11個(gè)樣本的杜鵑屬種進(jìn)行了ITS2片段和7條cpDNA片段序列測(cè)定,并使用基于形態(tài)學(xué)特征的數(shù)量分類學(xué)方法,對(duì)22種北方耐寒杜鵑資源及其近緣種進(jìn)行了聚類分析。主要研究結(jié)果如下:
 ?。?)借助于NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中現(xiàn)有杜鵑屬的ITS2序列,以掃帚巖須和吊鐘花為外類群,對(duì)杜鵑屬9亞屬92種杜鵑的ITS2序列進(jìn)行了分子系統(tǒng)學(xué)分析。結(jié)果表明:杜鵑屬是一個(gè)多系類群,各亞屬進(jìn)化程度基本平衡;所分析的6種植物中照山白、迎紅杜鵑、杜鵑、羊

3、躑躅均聚在以各自亞屬種為主的大支中;毛枝杜鵑亞屬、糙葉杜鵑亞屬、迎紅杜鵑亞屬和杜鵑亞屬系統(tǒng)位置交錯(cuò),遺傳進(jìn)化關(guān)系比較復(fù)雜;羊躑躅亞屬、葉狀苞亞屬均位于系統(tǒng)發(fā)育樹基部,符合形態(tài)學(xué)分類結(jié)果;馬銀花亞屬的長(zhǎng)蕊組、馬銀花組與常綠杜鵑亞屬的常綠杜鵑組分別得到較高的支持,但常綠杜鵑組的亞組區(qū)分不明顯。
  (2)通過(guò)PCR反應(yīng)在13條備選條碼中有7條可以擴(kuò)增出序列,即:accD、matK、ndhJ、rbcL、rpoC、ycf5、rpoC1,這

4、7條序列的測(cè)序成功率均為100%。7條備選條碼中,rbcL、matK、rpoC1具有較好的區(qū)分效果,accD和rpoC需要與其他條碼組合才能有較好的應(yīng)用效果。
 ?。?)應(yīng)用SPSS18.0軟件,使用基于形態(tài)學(xué)性狀的數(shù)量分類法,將22種杜鵑屬植物聚類為3個(gè)大支和1個(gè)單支。在距離系數(shù)=17的水平線以下可作為亞屬的劃分界限,且對(duì)北方耐寒杜鵑資源及其近緣種具有較好的區(qū)分效果,但未能找到合適的距離系數(shù)對(duì)亞屬下等級(jí)進(jìn)行劃分。
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