淺色黃姑魚(yú)和凡納濱對(duì)蝦養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析.pdf

1、本文采用線粒體16S rRNA基因結(jié)合PCR-RFLP技術(shù)，對(duì)淺色黃姑魚(yú)2個(gè)養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性進(jìn)行了分析，并對(duì)石首魚(yú)科種屬間的遺傳關(guān)系進(jìn)行了探討；對(duì)凡納濱對(duì)蝦不同世代7個(gè)養(yǎng)殖群體的生長(zhǎng)性狀和遺傳多樣性進(jìn)行了研究。旨在為淺色黃姑魚(yú)和凡納濱對(duì)蝦種質(zhì)資源的保護(hù)、合理利用和養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的持續(xù)發(fā)展提供基礎(chǔ)資料，并為后續(xù)研究工作打下基礎(chǔ)。 (1)PCR擴(kuò)增100個(gè)淺色黃姑魚(yú)個(gè)體的線粒體16S rRNA基因片段序列，得到大約620 bp的擴(kuò)增產(chǎn)

2、物。將其中5個(gè)個(gè)體的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序和同源比對(duì)，得到468bp可供比對(duì)分析的片段。比對(duì)結(jié)果表明，5條序列包括兩個(gè)單倍型，兩個(gè)單倍型之間有1個(gè)堿基突變。PCR-RFLP分析結(jié)果顯示，2個(gè)群體的100個(gè)樣品中，98％的個(gè)體為一種單倍型，只有2％的個(gè)體呈另一種單倍型，表明這2個(gè)群體的遺傳多樣性較低。兩個(gè)單倍型平均堿基組成為：T 22.0％，C 26.3％，A 29.8％，G 21.9％，GC含量平均為48.2％。與GenBank中石首魚(yú)科7屬

3、9種的11條同源序列比對(duì)，得到429個(gè)比對(duì)位點(diǎn)，其中包括69個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)、55個(gè)單突變子和16個(gè)插入/缺失位點(diǎn)。聚類(lèi)分析顯示淺色黃姑魚(yú)與黃姑魚(yú)親緣關(guān)系較近，與形態(tài)分類(lèi)相符。 (2)對(duì)凡納濱對(duì)蝦(Litopenaeus vannamei)的海南群體(進(jìn)口親蝦繁育的第1世代：G1)、山東和饒平群體(G2)、湛江2和湛江3群體(G3)、湛江1和上海群體(G4)共7個(gè)養(yǎng)殖群體4個(gè)世代1150個(gè)個(gè)體的生長(zhǎng)性狀(體長(zhǎng)和體重)進(jìn)行了分析。7

4、個(gè)群體的平均體長(zhǎng)(范圍)分別為14.76(13.25-15.99)、8.46(6.28-10.48)、9.24(4.28-10.70)、7.75(5.13-9.36)、11.38(8.13-14.12)、5.25(3.47-6.83)和7.14(4.14-9.00)，變異系數(shù)分別為0.04、0.08、0.08、0.09、0.12、0.14、0.14，平均體重(范圍)分別為33.41(24.33-39.74)、5.19(1.80-9.68

5、)、6.95(3.18-11.34)、4.62(1.52-9.87)、15.03(6.00-26.96)、1.47(0.48-3.42)、3.29(0.49-6.20)，變異系數(shù)分別為0.10、0.23、0.21、0.27、0.32、0.39、0.36。體長(zhǎng)和體重的變異系數(shù)隨著繁育世代的增加而增加，其中體重的變異系數(shù)每繁殖1代增加10％，其第1代的變異系數(shù)與美國(guó)選育的親本群體相同。體長(zhǎng)、體重相關(guān)與回歸分析表明，體長(zhǎng)與體重相關(guān)極顯著(P<

6、0.01)，體長(zhǎng)和體重的回歸方程為Y=0.01X<'2.93>。表明隨著繁育世代的增加，生長(zhǎng)性狀逐代分化。 (3)從21對(duì)微衛(wèi)星引物中篩選出12對(duì)有效擴(kuò)增的引物，對(duì)7個(gè)群體共280個(gè)個(gè)體擴(kuò)增，得到10個(gè)多態(tài)位點(diǎn)。多態(tài)位點(diǎn)比例為83.33％。10個(gè)多態(tài)位點(diǎn)中，每個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)量在2-15個(gè)之間。7個(gè)群體的平均遺傳偏離指數(shù)D為負(fù)值，表明雜合子缺失現(xiàn)象的存在。對(duì)7個(gè)群體，10個(gè)多態(tài)位點(diǎn)(7×10)進(jìn)行Hardy-Weinbemg平

7、衡檢測(cè)，共有54個(gè)偏離Hardy-Weinbemg平衡。對(duì)7個(gè)群體間的遺傳分化水平進(jìn)行檢測(cè)，得到近交系數(shù)F<,IS>在9個(gè)多態(tài)位點(diǎn)均為正值，兩兩群體間的固定指數(shù)F<,ST>值在0.1489-0.3746之間。F<,ST>顯著性檢驗(yàn)表明，各群體之間的遺傳分化極顯著(P<0.01)。分子方差分析結(jié)果顯示，大部分遺傳變異(72.17％)來(lái)自于群體內(nèi)，群體間的遺傳變異(27.83％)較小。 上述分析表明淺色黃姑魚(yú)2個(gè)養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性