河北小尾寒羊系統(tǒng)進(jìn)化和mtDNA遺傳多樣性研究.pdf

1、河北小尾寒羊是小尾寒羊的一個(gè)分支，主要分布在河北省南部黑龍港流域，四肢較短且肉用體型較好，具有早熟、多胎、多羔、生長(zhǎng)快、產(chǎn)肉多、裘皮好、遺傳性穩(wěn)定和適應(yīng)性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn)。因此，對(duì)該種群的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系及多樣性情況研究很有必要。
　　本研究采用測(cè)序方法獲得線粒體基因組序列，進(jìn)行河北小尾寒羊編碼區(qū)變異分析;以山東小尾寒羊、蘇尼特羊、洼地綿羊、湖羊?yàn)閰⒄諏?duì)象，分析了河北小尾寒羊與上述種群的親緣關(guān)系以及母系起源、遺傳多樣性，并探討以mtDNA C

2、OI基因作為條形碼鑒別綿羊品種的可行性。結(jié)果表明:河北小尾寒羊線粒體基因組編碼區(qū)共發(fā)現(xiàn)183個(gè)變異位點(diǎn)，其中多肽編碼區(qū)156個(gè)，RNA基因19個(gè)和tRNA基因8個(gè);多肽編碼區(qū)發(fā)現(xiàn)同義突變128個(gè)，錯(cuò)義突變28個(gè)。5個(gè)綿羊種群mtDNA Cytb基因共發(fā)現(xiàn)59個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，形成45種單倍型，單倍型多樣度范圍為0.681～0.953;核苷酸多樣度范圍為0.00133～0.00371;全群平均核苷酸差異數(shù)k為3.08608。5個(gè)綿羊種群mtDN

3、A D-loop區(qū)序列共發(fā)現(xiàn)了135個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，形成了108種單倍型。單倍型多樣度范圍為0.974～0.996;核苷酸多樣度范圍為0.01720～0.02222;全群平均核苷酸差異數(shù)k為20.795。表明河北小尾寒羊與其他四個(gè)種群遺傳多樣性豐富。NJ系統(tǒng)發(fā)育樹表明河北小尾寒羊與洼地綿羊先聚在一起，再與湖羊聚在一起，最后與蘇尼特羊和山東小尾寒羊聚在一起，表明河北小尾寒羊與洼地綿羊遺傳距離最近。COI基因片段的條形碼分析表明，河北小尾寒羊和

4、洼地綿羊相似性高達(dá)100％，和山東小尾寒羊相似性為99.4％，但未發(fā)現(xiàn)某個(gè)種群的獨(dú)立單倍型，因此，該COI基因片段不適合進(jìn)行綿羊種群鑒定，利用COI基因?yàn)閰⒖蓟虻南到y(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果與Cytb基因及D-loop區(qū)一致，表明COI基因可作綿羊系統(tǒng)進(jìn)化分析。結(jié)論:河北小尾寒羊與洼地綿羊遺傳距離最近，其次為湖羊、蘇尼特羊、山東小尾寒羊。該種群遺傳多樣性豐富，與山東小尾寒羊、蘇尼特羊、湖羊、洼地綿羊等種群存在基因交流。COI基因中該DNA條形碼檢