江蘇主要湖泊日本沼蝦遺傳多樣性及系統(tǒng)進(jìn)化研究.pdf

1、日本沼蝦(Macrobrachium nipponense)是我國(guó)最主要的淡水經(jīng)濟(jì)養(yǎng)殖蝦類，江蘇省是我國(guó)日本沼蝦種質(zhì)資源分布廣、利用高的主要省份之一。開(kāi)展日本沼蝦種質(zhì)資源研究對(duì)其種質(zhì)保護(hù)和利用、良種選育、提高養(yǎng)殖產(chǎn)量等具有重要作用。本研究共收集了江蘇省五個(gè)主要湖泊37個(gè)日本沼蝦野生群體，包括太湖群體15個(gè)、洪澤湖群體9個(gè)、高郵湖群體7個(gè)、駱馬湖群體4個(gè)、白馬湖群體2個(gè)。利用實(shí)驗(yàn)室自行開(kāi)發(fā)的日本沼蝦微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR)分析了這些湖泊日本沼

2、蝦群體的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)，主要內(nèi)容如下：1.太湖日本沼蝦遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)研究
　　 利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析了太湖湖區(qū)的廟港、渡口、陸巷等15個(gè)日本沼蝦野生群體的遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明：8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)呈現(xiàn)高度多態(tài)性；經(jīng)Bonferroni法校正(P＜0.003)后，各群體仍大部分有5～6個(gè)位點(diǎn)顯示雜合不足，顯著偏離Hardy-Weinberg平衡；15個(gè)野生群體表現(xiàn)出很高的遺傳多樣性水平，太湖東、南部的渡口和陸巷等群體

3、遺傳多樣性高于西、北部的華莊和洋渚等群體；突變-漂移平衡分析表明，太湖15個(gè)群體部分位點(diǎn)雜合顯著過(guò)剩，表明太湖群體部分位點(diǎn)偏離了突變-漂移平衡，且在近期經(jīng)歷過(guò)瓶頸效應(yīng)，群體數(shù)量曾經(jīng)下降；群體間FST及AMOVA分析表明，群體遺傳分化程度低(FsT=0.0106＜0.05)，但達(dá)到極顯著水平(P＜0.01)；基于DA遺傳距離構(gòu)建的UPGMA聚類樹(shù)顯示太湖15個(gè)群體聚成4支：太湖東部群體聚為一支，渤公島群體與吳塘門(mén)群體各為一支，其他湖區(qū)群體

4、聚為一支。2.洪澤湖日本沼蝦遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)研究
　　 利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析了洪澤湖湖區(qū)避風(fēng)港、蔣壩、鮑集等9個(gè)日本沼蝦野生群體的遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明：8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)呈現(xiàn)高度多態(tài)性；經(jīng)Bonferroni法校正(P＜0.004)后,每個(gè)群體中仍大部分有5～6個(gè)位點(diǎn)顯示雜合不足，顯著偏離Hardy-Weinberg平衡；日本沼蝦9個(gè)野生群體表現(xiàn)出較高的遺傳多樣性水平，洪澤湖東、南部的蔣壩和老子山等群體遺傳多樣性高于西、

5、北部鮑集和界集群體。突變-漂移平衡分析表明，洪澤湖日本沼蝦群體部分位點(diǎn)雜合顯著過(guò)剩，表明洪澤湖日本沼蝦群體部分位點(diǎn)偏離了突變-漂移平衡，但近期沒(méi)有發(fā)生瓶頸效應(yīng)，群體數(shù)量也沒(méi)有下降。群體間FST及AMOVA分析表明，群體遺傳分化程度低(FST=0.0155)，但達(dá)到極顯著水平(P＜0.01)；基于DA遺傳距離構(gòu)建的UPGMA聚類樹(shù)顯示，地理位置相鄰的群體聚在一起。3.江蘇五個(gè)主要湖泊日本沼蝦遺傳多樣性及系統(tǒng)進(jìn)化分析
　　 利用微衛(wèi)

6、星標(biāo)記分析了江蘇五個(gè)主要湖泊37個(gè)日本沼蝦野生群體的遺傳多樣性及系統(tǒng)進(jìn)化。結(jié)果表明；8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)呈現(xiàn)高度多態(tài)性；經(jīng)Bonferroni法校正(P＜0.004)后，大部分群體仍有5～6個(gè)位點(diǎn)顯示雜合不足，顯著偏離Hardy-Weinberg平衡；37個(gè)野生群體表現(xiàn)出較高的遺傳多樣性水平，太湖群體遺傳多樣性最高，其次為高郵湖群體，白馬湖群體最低；突變-漂移平衡分析表明，五個(gè)湖泊群體部分位點(diǎn)雜合顯著過(guò)剩，表明37個(gè)群體部分位點(diǎn)偏離了突變-漂

7、移平衡，且在近期經(jīng)歷過(guò)瓶頸效應(yīng)，群體數(shù)量曾經(jīng)下降；群體間FST及AMOVA分析表明，37個(gè)群體間遺傳固定指數(shù)FST介于0.0047～0.0733之間，屬于中等偏低程度的分化(0.05＜Fsr＜0.15)，而五個(gè)湖泊間日本沼蝦群體遺傳分化程度低(FsT=0.0072)，但達(dá)到極顯著水平(P＜0.01)；基于DA遺傳距離構(gòu)建的UPGMA聚類樹(shù)顯示，五個(gè)湖泊群體以長(zhǎng)江為界被分為南北兩個(gè)族群，其中太湖群體單獨(dú)為一個(gè)族群，其他四個(gè)湖泊群體聚為另一