三種鮑線粒體基因測序及系統(tǒng)發(fā)育分析.pdf

1、線粒體16S rRNA、COⅠ、COⅡ基因是物種線粒體基因研究中比較普遍的基因序列，在群體遺傳結(jié)構(gòu)，種系發(fā)生及親緣關(guān)系研究等方面應(yīng)用廣泛，是比較忠實(shí)的遺傳分子標(biāo)記。本文選取中國的皺紋盤鮑（H.discus hannai），澳大利亞的黑唇鮑(H.rubra)和新西蘭的黑足鮑(H.iris)3種典型經(jīng)濟(jì)鮑作為研究對象，通過測定其線粒體16S rRNA、COⅠ、COⅡ基因序列片段，來分析其單核苷酸多態(tài)性及種內(nèi)種間一致性和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，為鮑的新

2、品種引進(jìn)、雜交育苗提供理論支持。
　　本研究主要獲得以下結(jié)果:
　　(1)三種鮑線粒體16S rRNA基因片段測序及系統(tǒng)發(fā)育分析
　　采用基因測序方法，對皺紋盤鮑(H.hannai)、黑足鮑(H.iris)和黑唇鮑(H.rubra)線粒體16S rRNA基因序列片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序。試驗(yàn)得到的序列長度分別為皺紋盤鮑544bp，黑唇鮑550bp，黑足鮑546bp; A+T堿基含量比例分別為皺紋盤鮑58.1％，黑唇鮑5

3、6.2％，黑足鮑56.4％;種內(nèi)一致性分別為皺紋盤鮑96.37％，黑唇鮑97.51％，黑足鮑99.06％。三種鮑的種間一致性為93.94％。皺紋盤鮑的堿基突變率為0.37％，黑足鮑的堿基突變率為0.55％，黑唇鮑的堿基突變率為0.36％。黑足鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.148，皺紋盤鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.116，皺紋盤鮑與黑足鮑間的遺傳距離為0.077。
　　(2)三種鮑線粒體COⅠ基因片段測序及系統(tǒng)發(fā)育研究分析
　　

4、采用基因測序方法，對皺紋盤鮑(H..hannai)、黑足鮑（H.iris）和黑唇鮑(H.rubra)線粒體COⅠ基因序列片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序。實(shí)驗(yàn)得到的序列長度分別為皺紋盤鮑554bp，黑唇鮑573bp，黑足鮑552bp; A+T堿基含量比例分別為皺紋盤鮑55.4％，黑唇鮑52.3％，黑足鮑53.5％;種內(nèi)一致性分別為皺紋盤鮑97.66％，黑唇鮑98.49％，黑足鮑97.42％。三種鮑的種間一致性為89.12％。皺紋盤鮑的堿基突變率

5、為0.36％，黑足鮑的堿基突變率為0.36％，黑唇鮑的堿基突變率為2.09％。黑足鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.204，皺紋盤鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.200，皺紋盤鮑與黑足鮑間的遺傳距離為0.186。
　　(3)種鮑線粒體COⅡ基因片段測序及系統(tǒng)發(fā)育研究分析
　　采用基因測序方法，對皺紋盤鮑(H..hannai)、黑足鮑（H.iris）和黑唇鮑(H.rubra)線粒體COⅡ基因序列片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序。實(shí)驗(yàn)得到的序列長

6、度分別為皺紋盤鮑151bp，黑唇鮑150bp，黑足鮑153bp; A+T堿基含量比例分別為皺紋盤鮑58.3％，黑唇鮑53.7％，黑足鮑56.5％;種內(nèi)一致性分別為皺紋盤鮑98.23％，黑唇鮑99.33％，黑足鮑91.83％。三種鮑的種間一致性為92.51％。皺紋盤鮑的堿基突變率為3.31％，黑足鮑的堿基突變率為19.61％，黑唇鮑的堿基突變率為2.00％。黑足鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.124，皺紋盤鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.192，