中國(guó)鹿類動(dòng)物線粒體12S rRNA基因序列的比較分析及分子系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf

1、該論文應(yīng)用線粒體12S rRNA基因全序列對(duì)中國(guó)鹿類動(dòng)物的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)行研究.實(shí)驗(yàn)共計(jì)完成中國(guó)鹿類14個(gè)物種21個(gè)個(gè)體的12S rRNA基因測(cè)序,獲得16個(gè)單倍型,并報(bào)送GenBank(序列號(hào):AY184425-AY184440).將上述序列與從GenBank檢索到的獐、麂、水鹿、牛、馬、羊、鼷鹿的12S rRNA基因全序列一起,通過應(yīng)用分子系統(tǒng)學(xué)理論與模型分析序列數(shù)據(jù),以及對(duì)12S rRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的分析,得出了以下主要結(jié)論:(1)用最

2、小進(jìn)化方法(ME)和鄰接法(NJ)對(duì)12S rRNA基因的全序列構(gòu)建分子系統(tǒng)樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)基本相同.(2)鹿科種內(nèi)距離小于1﹪(0.1﹪-0.42﹪);鹿屬內(nèi)的物種間距離小于4﹪(1.29﹪-3.44﹪);鹿亞科內(nèi)物種間距離為4.65﹪-8.86﹪;鹿科與?？崎g的距離為11.75﹪-14.13﹪.(3)分子系統(tǒng)學(xué)結(jié)果支持狍從美洲鹿亞科轉(zhuǎn)入獐亞科,并為其中的一個(gè)獨(dú)立的屬(狍屬).(4)黑麝與馬麝的12S rRNA基因序列完全相同,12S r

3、RNA基因數(shù)據(jù)不支持黑麝與馬麝為兩個(gè)種.(5)該實(shí)驗(yàn)結(jié)果支持麝作為上科的分類階元存在.(6)12S rRNA基因的堿基代換中轉(zhuǎn)換數(shù)遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于顛換數(shù)(2-20倍).(7)12S r RNA基因二級(jí)結(jié)構(gòu)中,全序列核苷酸的堿基組成腺嘌呤(A)最多(平均為36.88﹪),鳥嘌呤最低(平均17.65﹪),與環(huán)區(qū)的堿基組成相類似.(8)環(huán)區(qū)的所有核苷酸堿基代換率為莖區(qū)的2.24倍,轉(zhuǎn)換率幾乎相同(0.051和0.082);而環(huán)區(qū)的顛換率卻高達(dá)莖區(qū)的1