中國鹿類動物線粒體12S rRNA基因序列的比較分析及分子系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf

1、該論文應用線粒體12S rRNA基因全序列對中國鹿類動物的系統(tǒng)發(fā)育進行研究.實驗共計完成中國鹿類14個物種21個個體的12S rRNA基因測序,獲得16個單倍型,并報送GenBank(序列號:AY184425-AY184440).將上述序列與從GenBank檢索到的獐、麂、水鹿、牛、馬、羊、鼷鹿的12S rRNA基因全序列一起,通過應用分子系統(tǒng)學理論與模型分析序列數(shù)據(jù),以及對12S rRNA二級結(jié)構(gòu)的分析,得出了以下主要結(jié)論:(1)用最

2、小進化方法(ME)和鄰接法(NJ)對12S rRNA基因的全序列構(gòu)建分子系統(tǒng)樹的拓撲結(jié)構(gòu)基本相同.(2)鹿科種內(nèi)距離小于1﹪(0.1﹪-0.42﹪);鹿屬內(nèi)的物種間距離小于4﹪(1.29﹪-3.44﹪);鹿亞科內(nèi)物種間距離為4.65﹪-8.86﹪;鹿科與?？崎g的距離為11.75﹪-14.13﹪.(3)分子系統(tǒng)學結(jié)果支持狍從美洲鹿亞科轉(zhuǎn)入獐亞科,并為其中的一個獨立的屬(狍屬).(4)黑麝與馬麝的12S rRNA基因序列完全相同,12S r

3、RNA基因數(shù)據(jù)不支持黑麝與馬麝為兩個種.(5)該實驗結(jié)果支持麝作為上科的分類階元存在.(6)12S rRNA基因的堿基代換中轉(zhuǎn)換數(shù)遠遠大于顛換數(shù)(2-20倍).(7)12S r RNA基因二級結(jié)構(gòu)中,全序列核苷酸的堿基組成腺嘌呤(A)最多(平均為36.88﹪),鳥嘌呤最低(平均17.65﹪),與環(huán)區(qū)的堿基組成相類似.(8)環(huán)區(qū)的所有核苷酸堿基代換率為莖區(qū)的2.24倍,轉(zhuǎn)換率幾乎相同(0.051和0.082);而環(huán)區(qū)的顛換率卻高達莖區(qū)的1