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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
1、本研究通過(guò)大鼠異氟醚麻醉模型,利用高通量microRNA芯片技術(shù)檢測(cè)不同濃度異氟醚暴露后大鼠皮層中microRNAs表達(dá)譜變化,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。
2、通過(guò)熒光素酶報(bào)告法在細(xì)胞水平對(duì)具有顯著性差異表達(dá)的microRNAs所預(yù)測(cè)的靶基因進(jìn)行驗(yàn)證。
方法:
1、大鼠異氟醚麻醉模型的建立及檢測(cè)不同濃度異氟醚暴露后大鼠皮層中microRNAs表達(dá)譜變化:雄性SD大鼠12只,體重250±
2、10g,隨機(jī)分為對(duì)照組(Sham)、2.0%異氟醚吸入組(P1組)、1.5%異氟醚吸入組(P2組)、0.75%異氟醚吸入組(P3組),各實(shí)驗(yàn)組均麻醉維持4h。麻醉結(jié)束后24h取大鼠大腦皮層組織,提取總RNA,通過(guò)高通量microRNA芯片技術(shù)檢測(cè)各組microRNA表達(dá)譜,篩選出顯著差異表達(dá)的microRNAs,并通過(guò)RT-qPCR驗(yàn)證結(jié)果。利用GO-Analysis進(jìn)行生物信息學(xué)分析,統(tǒng)計(jì)采用χ2檢驗(yàn)和fisher檢驗(yàn)的原理,計(jì)算得到
3、p值與p(k)值,后多重比較,得出GO-Analysis的誤判率(FDR),根據(jù)FDR值判斷差異是否具有顯著性;Pathway-Analysis是應(yīng)用fisher精確檢驗(yàn)和χ2檢驗(yàn)對(duì)microRNAs可能參與的所有Pathway進(jìn)行分析。
2、熒光素酶報(bào)告法檢測(cè)rno-let-7d可以調(diào)控靶基因PIK3IP1:rno-let-7d為異氟醚暴露后大鼠皮層表達(dá)發(fā)生變化的miRNA之一,利用 targetscan軟件預(yù)測(cè)到rno-l
4、et-7d可能參與調(diào)控靶基因PIK3IP1,通過(guò)PIK3IP13’UTR預(yù)測(cè)靶點(diǎn)構(gòu)入熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒,利用rno-let-7d mimics及陰性對(duì)照microRNA-NC分別和PIK3IP1野生型靶標(biāo)共轉(zhuǎn)做雙熒光檢測(cè),轉(zhuǎn)染48h后觀察細(xì)胞狀態(tài)并拍照,并裂解細(xì)胞,測(cè)試luciferase活性。
結(jié)果:MicroRNA芯片檢測(cè)結(jié)果顯示在不同濃度異氟醚暴露后中大鼠皮層共有29個(gè)microRNAs發(fā)生了表達(dá)變化具有顯著性:其中在2.
5、0%異氟醚吸入組(P1組)中19個(gè),1.5%異氟醚吸入組(P2組)13個(gè),0.75%異氟醚吸入組(P3組)4個(gè)(三組部分重疊)。通過(guò)隨機(jī)挑選的部分表達(dá)差異具有顯著性miRNAs進(jìn)行RT-PCR檢測(cè)證明microRNA芯片結(jié)果是真實(shí)有效。這些microRNAs參與調(diào)控以下信號(hào)通路如Metabolic pathways(代謝途徑)、MAPK信號(hào)通路(MAPK signaling pathway)、T細(xì)胞受體信號(hào)傳導(dǎo)途徑(T cell rec
6、eptor signaling pathway)、PI3K-Akt信號(hào)傳導(dǎo)途徑(PI3K-Akt signaling pathway)、神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子信號(hào)通路(Neurotrophin signaling pathway)等。let-7d為異氟醚暴露后大鼠皮層表達(dá)發(fā)生變化的microRNA之一,通過(guò) let-7d mimics表達(dá)后測(cè)試luciferase活性發(fā)現(xiàn),其對(duì)PIK3IP13’UTR有抑制作用,從而證實(shí)PIK3IP1是let-7
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