利用RHL群體精細定位一個控制水稻谷殼硅含量的QTL.pdf

1、水稻具有高含量的硅是水稻區(qū)別于其它禾本科作物的一個重要特征，而在水稻各組織器官中以谷殼中含量為最高。以往的研究側重于生理學和土壤肥料學，而對其遺傳機理報道較少。本研究利用前期定位結果，構建了一套剩余雜合體(RHL)衍生群體，開展水稻谷殼硅含量(HUS)QTL的精細定位研究。 本實驗室在前期研究中，以珍汕97B/密陽46重組自交系(RIL)群體為材料，在第6染色體短臂檢測到一個控制水稻谷殼硅含量的QTL(qHUS-6)，其貢獻率達

2、17.4％。在本研究中，應用來源于612個珍汕97B/密陽46RIL各1個F7單株的DNA，經(jīng)SSR標記篩選，得到一個在第6染色體短臂RM587-RM276之間呈雜合型、在其它基因組區(qū)間基本呈純合型的單株，自交后得到一個由221個株系組成的F2:3群體，應用于qHUS-6的精細定位。主要結果如下： 1.2004年冬-2005年春在海南省陵水育種基地種植含有221個株系的完整群體，構建了在RM587和RM276范圍內含16個標記的

3、遺傳圖譜，分株系測定谷殼硅含量，檢測到一個控制谷殼硅含量的QTL，最高LOD值位于RM510和RM204之間，距RM510為0.1cM；LOD值為20.4，加性效應為1.88％，顯性效應為1.41％，顯性度為0.75，表現(xiàn)為正向不完全顯性。該QTL位于前期檢測到的qHUS-6所處區(qū)間，增效等位基因都來自父本密陽46，但對群體的貢獻率升至34.9％。 2.從221個株系中篩選出105個在16個標記區(qū)間內發(fā)生重組的株系，構成亞群體，

4、利用完整群體構建的圖譜來檢測QTL，以進一步驗證上述結果。所得結果與完整群體基本一致，最高LOD值位置不變，LOD值為17.1，加性效應為1.97％，增效等位基因來自父本密陽46，顯性效應為1.15％，顯性度為0.58，表現(xiàn)為正向不完全顯性，貢獻率升至51.0％。 3.根據(jù)221個株系的標記基因型檢測結果，篩選到10個在RM587和RM510標記座位處呈雜合基因型的株系，每株系取10個單株分別檢測RM587和RM510的基因型，

5、篩選到兩標記都表現(xiàn)為母本純合、父本純合和雜合的三組材料共71株，測定各單株的表現(xiàn)型，進行方差分析；結果表明，三組材料的谷殼硅含量呈極顯著差異，說明控制硅含量的QTL與標記RM587和RM510連鎖。以各組的表現(xiàn)型平均值為基礎計算，其加性效應為0.69％，增效等位基因仍來自父本密陽46，但顯性效應為-0.80％，表現(xiàn)為負向完全顯性。該結果進一步驗證了qHUS-6與RM587和RM510的緊密連鎖關系，同時表明該基因的效應可能因環(huán)境變異而發(fā)