水稻第6染色體短臂硅含量QTL的分解和色素原基因C的精細定位.pdf

1、水稻是世界上最重要的糧食作物之一,具有高含量的硅是它的一個重要特征.水稻各部分色澤由C-A-P系統(tǒng)控制,其中色素原基因 C 是產(chǎn)生色素的基礎(chǔ)基因. 前期研究利用珍汕97B/密陽46重組自交系群體,在第6染色體短臂檢測到控制水稻硅含量QTLs.本研究利用在目的區(qū)間RM587-RMl9784雜合、背景純合的一個F7單株,即剩余雜合體,這種材料相當于近等基因系材料配對雜交產(chǎn)生的F<,1>,自交得到由221個株系組成的F<,3>群體,定

2、位水稻硅含量QTLs;同時針對水稻第6染色體短臂色素原基因C的可能位置,從該F3群體中篩選到在C基因周圍區(qū)間呈不同基因型組合的7個剩余雜合體(RHL),收獲種子建立F<,2:3>群體,進行C基因的精細定位. 主要結(jié)果如下: 2005年夏在浙江省富陽基地種植221個F<,3>株系,分株系測定F<,3>群體莖稈和劍葉的硅含量.應用覆蓋目標區(qū)間RM587-RM19784由15個SSR標記組成的遺傳圖譜,檢測到3個控制莖稈硅含量

3、QTLs和2個控制劍葉硅含量QTLs-3個控制莖稈硅含量的QTLs分別位于RM225-RM6917、RM6119-RM314和RMl9715-RMl9784區(qū)間,最高LOD值分別為7.9、5,5和19.6,距RM587分別為3.0 cM、18.9 cM和59.8 cM,加性效應分別為-0.78﹪、0.27﹪和-0.64﹪,顯性效應分別為-0.38﹪、-0.30﹪和0.31﹪,顯性度分別為-0.49、-1.14和0.49,貢獻率分別為9.

4、8﹪、6.7﹪和28.3﹪.2個控制劍葉硅含量的QTLs分別位于RM225-RM6917和RM19715-RM19784區(qū)間,最高LOD值都為20.0,距RM587分別為3.0 cM和59.3 cM,加性效應分別為1.02﹪和0.78﹪,顯性效應分別為0.98﹪和-0.32﹪,顯性度分別為0.96和-0.41,貢獻率分別為26.5﹪和32.8﹪. 2006年春在海南省陵水基地種植7套RHL衍生的F2群體,通過對各個群體顏色表現(xiàn)和

5、原RHL基因型的比較,將c基因定位于微衛(wèi)星標記RM314與RM253之間.在該基礎(chǔ)上,應用兩個分離群體共1279個樣本,經(jīng)標記檢測和連鎖分析,進一步將C基因定位于RM111和RM253之間,與RMlll和RM253的遺傳距離分別為0.7 cM和0.4 cM.最后,應用區(qū)間內(nèi)的另外6個微衛(wèi)星標記和1個源于C基因候選基因OsCl的標記,檢測在RMl ll-C基因一RM253區(qū)間內(nèi)發(fā)生了重組的22個個體,將C基因定位于一個大小為59.3 kb