CO2濃度倍增處理下寧夏枸杞果實(shí)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析.pdf

1、寧夏枸杞（Lycium barbarumL.）是茄科(Solanac eae)枸杞屬(LyciumL.)植物，果實(shí)中含有糖脂、類胡蘿卜素、多酚類、枸杞多糖等多種生物活性物質(zhì)。本課題組前期研究表明CO2濃度倍增處理下寧夏枸杞果實(shí)主要生物活性物質(zhì)含量降低。為進(jìn)一步從分子水平揭示CO2濃度倍增處理下寧夏枸杞果實(shí)糖代謝的響應(yīng)機(jī)理，本試驗(yàn)采用植物生理學(xué)試驗(yàn)方法、新一代高通量測(cè)序Illumina HiSeq2500技術(shù)及qRT-PCR技術(shù)方法，旨在

2、從不同角度揭示CO2濃度倍增處理對(duì)寧夏枸杞果實(shí)的影響。研究結(jié)果如下:
　　1.在高濃度CO2下，夏果中(CO2處理90d)，合成酶類和分解酶類酶活性均為處理組高于對(duì)照組，其中轉(zhuǎn)化酶(AI、NI)活性差異極顯著;秋果中（CO2處理120d）合成酶類與分解酶類較夏果活性均有降低，分解酶類活性為處理組高于對(duì)照組，合成酶類活性為處理組低于對(duì)照組且其中SS合成方向差異極顯著，由此得出AI、NI或?yàn)楦邼舛菴O2下蔗糖代謝響應(yīng)的關(guān)鍵酶。

3、　　2.寧夏枸杞果實(shí)成熟期樣品CK（OTC氣室中，整個(gè)生長(zhǎng)期內(nèi)CO2濃度為350±20μmol·mol-1）、TR（OTC氣室中，整個(gè)生長(zhǎng)期內(nèi)CO2濃度為700±20μmol· mol-1）、CT（自然環(huán)境條件下，整個(gè)生長(zhǎng)期內(nèi)CO2濃度為350±20μmol·mol-1）共6個(gè)樣品提取RNA（兩組為一個(gè)生物學(xué)重復(fù)，共分3組），經(jīng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序后共獲得44.45Gb Clean Data，各樣品Clean Data均達(dá)到6.66Gb，Q30堿

4、基百分比在86.38％及以上。經(jīng)De novo組裝后共獲得81，100條Unigene，獲得注釋信息的為35，111個(gè)，其中長(zhǎng)度在1kb以上的Unigene有21，005條，占整體Unigene的25.9％。進(jìn)行基于所得Unigene庫(kù)的基因結(jié)構(gòu)分析，其中SSR分析共獲得9，931個(gè)SSR標(biāo)記，同時(shí)還進(jìn)行了CDS預(yù)測(cè)和SNP分析。
　　3.對(duì)不同CO2濃度處理下寧夏枸杞果實(shí)成熟期測(cè)序所得結(jié)果進(jìn)行組間兩兩對(duì)比發(fā)現(xiàn):CK與TR相比所涉