CO2濃度倍增處理下寧夏枸杞果實轉(zhuǎn)錄組測序及分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、寧夏枸杞(Lycium barbarumL.)是茄科(Solanac eae)枸杞屬(LyciumL.)植物,果實中含有糖脂、類胡蘿卜素、多酚類、枸杞多糖等多種生物活性物質(zhì)。本課題組前期研究表明CO2濃度倍增處理下寧夏枸杞果實主要生物活性物質(zhì)含量降低。為進一步從分子水平揭示CO2濃度倍增處理下寧夏枸杞果實糖代謝的響應機理,本試驗采用植物生理學試驗方法、新一代高通量測序Illumina HiSeq2500技術(shù)及qRT-PCR技術(shù)方法,旨在

2、從不同角度揭示CO2濃度倍增處理對寧夏枸杞果實的影響。研究結(jié)果如下:
  1.在高濃度CO2下,夏果中(CO2處理90d),合成酶類和分解酶類酶活性均為處理組高于對照組,其中轉(zhuǎn)化酶(AI、NI)活性差異極顯著;秋果中(CO2處理120d)合成酶類與分解酶類較夏果活性均有降低,分解酶類活性為處理組高于對照組,合成酶類活性為處理組低于對照組且其中SS合成方向差異極顯著,由此得出AI、NI或為高濃度CO2下蔗糖代謝響應的關(guān)鍵酶。

3、  2.寧夏枸杞果實成熟期樣品CK(OTC氣室中,整個生長期內(nèi)CO2濃度為350±20μmol·mol-1)、TR(OTC氣室中,整個生長期內(nèi)CO2濃度為700±20μmol· mol-1)、CT(自然環(huán)境條件下,整個生長期內(nèi)CO2濃度為350±20μmol·mol-1)共6個樣品提取RNA(兩組為一個生物學重復,共分3組),經(jīng)轉(zhuǎn)錄組測序后共獲得44.45Gb Clean Data,各樣品Clean Data均達到6.66Gb,Q30堿

4、基百分比在86.38%及以上。經(jīng)De novo組裝后共獲得81,100條Unigene,獲得注釋信息的為35,111個,其中長度在1kb以上的Unigene有21,005條,占整體Unigene的25.9%。進行基于所得Unigene庫的基因結(jié)構(gòu)分析,其中SSR分析共獲得9,931個SSR標記,同時還進行了CDS預測和SNP分析。
  3.對不同CO2濃度處理下寧夏枸杞果實成熟期測序所得結(jié)果進行組間兩兩對比發(fā)現(xiàn):CK與TR相比所涉

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