綠頭鴨MHCI類基因遺傳多樣性研究.pdf

1、綠頭鴨為我國(guó)家鴨的祖先之一，我國(guó)野生鴨類種群曾較為豐富，但由于過度獵取和生境條件改變，致使種群數(shù)量日趨減少。野生鴨類分布廣泛，大部分為遷徙性鳥類，是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)鳥類。作為遷移性水禽的代表物種，綠頭鴨在病毒傳播過程中發(fā)揮著一定的作用。研究表明雁形目鳥類的病毒檢出率遠(yuǎn)高于其他鳥類。主要組織相容性復(fù)合體(major histocompatibility complex，MHC)是廣泛存在于脊椎動(dòng)物中并編碼免疫球蛋白樣受體的高度多態(tài)的基因群，

2、其產(chǎn)物與免疫系統(tǒng)調(diào)節(jié)，生長(zhǎng)發(fā)育、生殖生理及衰老均密切關(guān)系，常作為功能性基因分子標(biāo)記來研究遺傳多樣性和分析種群疾病抵抗能力。目前已證實(shí)相關(guān)物種中不同單倍型對(duì)流感病毒抗性存在差異。
　　本研究以綠頭鴨為研究對(duì)象，通過cDNA確定MHCⅠ類分子的表達(dá)位點(diǎn)，利用RACE技術(shù)獲取表達(dá)位點(diǎn)的序列全長(zhǎng)，并根據(jù)此設(shè)計(jì)MHCⅠ類分子抗原呈遞區(qū)（外顯子2和外顯子3）的單位點(diǎn)擴(kuò)增引物，建立分位點(diǎn)擴(kuò)增體系。并且對(duì)50只綠頭鴨進(jìn)行MHCⅠ類表達(dá)位點(diǎn)的PCR

3、-SSCP多態(tài)性分析，并進(jìn)行分型，從而進(jìn)行群體遺傳多樣性分析。
　　結(jié)果表明綠頭鴨存在兩個(gè)MHCⅠ類表達(dá)位點(diǎn)，通過對(duì)多物種MHCⅠ類基因的氨基酸序列比對(duì)和聚類分析表明，綠頭鴨和鵝親緣關(guān)系最近，其次為雞。群體調(diào)查發(fā)現(xiàn)其外顯子2、外顯子3都具有很高的多態(tài)性，以顛換突變?yōu)橹?。外顯子2和外顯子3的GC含量分別為59.6％和51.2％，第三位密碼子位點(diǎn)的GC含量分別為89.7％和73.6％，這說明外顯子2受到的突變壓更大，這與外顯子結(jié)合抗原