綠頭鴨MHCI類基因遺傳多樣性研究.pdf

1、綠頭鴨為我國家鴨的祖先之一，我國野生鴨類種群曾較為豐富，但由于過度獵取和生境條件改變，致使種群數(shù)量日趨減少。野生鴨類分布廣泛，大部分為遷徙性鳥類，是我國重要的經(jīng)濟鳥類。作為遷移性水禽的代表物種，綠頭鴨在病毒傳播過程中發(fā)揮著一定的作用。研究表明雁形目鳥類的病毒檢出率遠高于其他鳥類。主要組織相容性復合體(major histocompatibility complex，MHC)是廣泛存在于脊椎動物中并編碼免疫球蛋白樣受體的高度多態(tài)的基因群，

2、其產(chǎn)物與免疫系統(tǒng)調(diào)節(jié)，生長發(fā)育、生殖生理及衰老均密切關(guān)系，常作為功能性基因分子標記來研究遺傳多樣性和分析種群疾病抵抗能力。目前已證實相關(guān)物種中不同單倍型對流感病毒抗性存在差異。
　　本研究以綠頭鴨為研究對象，通過cDNA確定MHCⅠ類分子的表達位點，利用RACE技術(shù)獲取表達位點的序列全長，并根據(jù)此設(shè)計MHCⅠ類分子抗原呈遞區(qū)（外顯子2和外顯子3）的單位點擴增引物，建立分位點擴增體系。并且對50只綠頭鴨進行MHCⅠ類表達位點的PCR

3、-SSCP多態(tài)性分析，并進行分型，從而進行群體遺傳多樣性分析。
　　結(jié)果表明綠頭鴨存在兩個MHCⅠ類表達位點，通過對多物種MHCⅠ類基因的氨基酸序列比對和聚類分析表明，綠頭鴨和鵝親緣關(guān)系最近，其次為雞。群體調(diào)查發(fā)現(xiàn)其外顯子2、外顯子3都具有很高的多態(tài)性，以顛換突變?yōu)橹?。外顯子2和外顯子3的GC含量分別為59.6％和51.2％，第三位密碼子位點的GC含量分別為89.7％和73.6％，這說明外顯子2受到的突變壓更大，這與外顯子結(jié)合抗原