亞麻抗白粉病基因的定位.pdf

1、亞麻（Linum usitatissmumL.）是亞麻科(Linaceae)亞麻屬(Linum)的一年生草本纖維植物。白粉病會危害亞麻的生長，其發(fā)病的特點是，亞麻的植株表面會蒙上一層白粉狀的菌絲層，病原菌會侵染從地上至植株頂端的各個部分，病情傳播較為快速，帶來的后果為亞麻提前衰亡，產(chǎn)量降低，經(jīng)濟效益下降等。
　　本實驗前期由黑龍江省農(nóng)業(yè)經(jīng)濟科學院楊學通過對田間抗病材料9801-1和感病材料Diane雜交、自交獲得的F1和F2代的田

2、間數(shù)據(jù)分析，證明F1代表現(xiàn)為完全抗病，F(xiàn)2代抗感分離比接近3∶1。證明抗病材料9801-1對白粉病抗性是完全顯性，是細胞核遺傳。
　　本實驗是在此基礎(chǔ)之上，采用分子標記技術(shù)，利用9801-1和Diane雜交自交獲得的高代回交群體BC3F6代，進行亞麻抗白粉病基因的定位分析。試驗所獲得的結(jié)果如下:
　　田間定期對亞麻的生長狀況進行觀察記錄，在亞麻白粉病發(fā)病期間獲得了亞麻白粉病孢子菌。在顯微鏡下觀察到白粉病孢子菌的形態(tài)，并且在田

3、間完成了接菌試驗。
　　首先我選用SSR、AFLP、ISSR三種分子標記技術(shù)對亞麻抗白粉病基因進行定位分析，經(jīng)過驗證分析未找到很明確的與抗病基因緊密連鎖的標記。
　　所以在此基礎(chǔ)上采取了對這兩個親本材料進行全基因組測序。測序中以Lusitatissimum.m erge.fa作為參考基因組。為了便于分析，將測序序列連成假染色體，構(gòu)建了2個DNA文庫，共得到了18.07G的Clean data。通過比對測序結(jié)果，分析得到了存在

4、reads的最長的11條染色體(Scaffold)的分布圖。同時對SNP、InDel、SV分布注釋情況進行統(tǒng)計分析。依據(jù)此數(shù)據(jù)，在有差異的位點處設(shè)計引物，試驗共設(shè)計了121對InDel標記，其覆蓋了11條染色體(Scaffold)。
　　通過對InDel標記的篩選，成功的獲得了一個與抗病基因緊密連鎖的標記，InDel標記f2x4105，它位于ChrNew02(第2條)染色體上，scaffold145附近，實現(xiàn)了亞麻抗白粉病基因的初