Markush結(jié)構(gòu)分析與檢索系統(tǒng).pdf

1、化學(xué)專利中普遍應(yīng)用的Markush結(jié)構(gòu)是由一個(gè)新穎的母體基團(tuán)和可變?nèi)〈M成,由于可變?nèi)〈膹?fù)雜性使得Markush結(jié)構(gòu)的檢索和匹配成為化學(xué)信息學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)難題.本論文在深入研究了現(xiàn)有Markush結(jié)構(gòu)處理方案和本課題組已有研究成果的基礎(chǔ)上,提出了一個(gè)處理Markush結(jié)構(gòu)的兩階段方案.首先進(jìn)行篩選,將Markush結(jié)構(gòu)中相對(duì)穩(wěn)定的環(huán)和環(huán)之間的連接片斷提取出來(lái)構(gòu)成族性結(jié)構(gòu)的骨架(Scaffold),利用SMILES擴(kuò)展算法程序?qū)Νh(huán)和非

2、環(huán)原子,特別是對(duì)芳香環(huán)原子的識(shí)別算法,實(shí)現(xiàn)了結(jié)構(gòu)式的程序分析,刪除環(huán)上的連接片斷,保留了環(huán)和環(huán)之間的連接片斷,利用程序自動(dòng)生成了Markush結(jié)構(gòu)的骨架.第二階段是在每一個(gè)骨架結(jié)構(gòu)上添加非環(huán)的可變?nèi)〈?提取其中的官能團(tuán)信息加以分析歸類,作為環(huán)的屬性描述.用面向?qū)ο蟪绦蛟O(shè)計(jì)方法(OOP)實(shí)現(xiàn)了骨架編碼方案的一系列算法,用Java語(yǔ)言完成了能夠運(yùn)行于網(wǎng)頁(yè)的Applet程序StruDraw,對(duì)提問(wèn)結(jié)構(gòu)式能夠?qū)崿F(xiàn)結(jié)構(gòu)的分析,對(duì)于檢索用戶起向?qū)?/p>