10247.人類dna序列8mer模體進化差異及酵母核小體結合序列特征分析

1、學校代碼：10126分類號：——論文題目學號：三!!壘魚QQl編號：——人類DNA序N8mer模體進化差異及酵母核小體結合序列特征分析學院：物理科學與技術學院專業(yè)：物理學研究方向：理論物理姓名：周德良指導教師：李宏教授2014年3月27日人類I)NA序列8mer模體進化差異及酵母核小體結合序列特征分析摘要本文從8mer模體和二階信息冗余出發(fā)，分析人類DNA8mer序列片段的進化分離與功能、酵母核小體中心序列與連接序列的功能差異、酵母核小

2、體中心序列的局域特征和核小體序列與組蛋白的相互作用。整個研究分為4部分，具體內容如下。1以人類1號染色體DNA序列為樣本，將其分成CDS、5’UTR、3UTR、內含子和基因間5類序列，分別計算它們的8mer相對模體頻數隨頻數的分布。發(fā)現(xiàn)CDS呈現(xiàn)單峰分布，5’UTR和3’UTR近似呈現(xiàn)單峰分布，內含子和基因間序列呈現(xiàn)明顯的3峰分布。將全部8mer按含有2個或2個以上、1個和O個CG二核苷分為CG2、CGl和CGo三個模體子集，重繪8me

3、r分布。發(fā)現(xiàn)三個模體子集可以形成獨立的分布，并且3個子集的分布中心與總體八模體3峰分布的分布中心相同。按其它15個二核苷分類出的三個模體子集則不能形成獨立分布。在CG模體中計算二核苷與三核苷的相對頻數，發(fā)現(xiàn)5類序列的二核苷與三核苷相對頻數分布，在CG2模體中基本相同，在CGl模體中相近，在CGo模體中差別最大。分析結果表明，CG2和CGl模體在進化上具有保守性，在不同序列中的使用具有趨同性，CGo模體在進化上具有多樣性，在不同序列中的使