16506.基于核基因非編碼區(qū)研究靈長(zhǎng)目舊大陸猴及新大陸猴系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系

1、獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過(guò)的研究成果，對(duì)本文的研究做出貢獻(xiàn)的集體和個(gè)人均已在論文中作了明確的說(shuō)明并表示了謝意。研究生簽名：盈竭日期：業(yè)：壘上論文使用和授權(quán)說(shuō)明本人完全了解云南大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：學(xué)校有權(quán)保留并向國(guó)家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交學(xué)位論文和論文電子版；允許論文被查閱或借閱；學(xué)?？梢怨颊?/p>

2、文的全部或部分內(nèi)容，可以采用影印、縮印或其他復(fù)制手段保存論文。(保密的論文在解密后應(yīng)遵循此規(guī)定)研究生簽名：導(dǎo)師簽名：蒯!積U、本人及導(dǎo)師同意將學(xué)位論文提交至清華大學(xué)“中國(guó)學(xué)術(shù)期刊(光盤版)電子雜志社”進(jìn)行電子和網(wǎng)絡(luò)出版，并編入CNKI系列數(shù)據(jù)庫(kù)，傳播本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容，同意按《中國(guó)優(yōu)秀博碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù)出版章程》規(guī)定享受相關(guān)權(quán)益。研究生簽名：——導(dǎo)師簽名：日期：云南大學(xué)博士學(xué)位論文屬，非洲疣猴包括3個(gè)屬，經(jīng)歷了快速輻射進(jìn)

3、化和近期物種形成事件。在以前的研究中，10個(gè)屬之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系倍受爭(zhēng)議，其中非洲疣猴的單系起源在Roos等人2011年報(bào)導(dǎo)中提出質(zhì)疑。本研究通過(guò)分析來(lái)自14個(gè)疣猴亞科物種和4個(gè)非疣猴亞科物種的44個(gè)核基因非編碼區(qū)(23kb)和線粒體基因組數(shù)據(jù)(16kb)，分析結(jié)果得到了不同的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)：44個(gè)核基因非編碼區(qū)數(shù)據(jù)結(jié)果支持在亞洲疣猴中，長(zhǎng)尾葉猴屬(Semnopithecus)和烏葉猴屬(Trachypithecus)聚為姐妹群，葉

4、猴屬(Presbytis)和奇鼻猴類群【0dd—nosedmonkey；包括金絲猴屬(Rhinopithecus)，白臀葉猴屬(Pygathrix)和長(zhǎng)鼻猴屬(Nasalis)]聚為姐妹群。而在奇鼻猴類群中，白臀葉猴屬和金絲猴屬的關(guān)系更近。線粒體基因組分析結(jié)果則支持亞洲疣猴中，長(zhǎng)尾葉猴屬最先分歧，奇鼻猴類群是葉猴屬和烏葉猴屬的姐妹群。而在奇鼻猴類群中，白臀葉猴屬和長(zhǎng)鼻猴屬關(guān)系更近。另外一個(gè)重要的結(jié)果是所有分析結(jié)果都不支持最近提出的”非洲

5、疣猴并系和雜交”的假說(shuō)，支持非洲疣猴的單系起源，認(rèn)為奇鼻猴類(oddnosedmonkey)屬于單系類群，包括金絲猴屬(Rhinopithecus)，白臀葉猴屬(Pygathrix)和長(zhǎng)鼻猴屬(Nasalis)，并支持非洲疣猴的單系起源。本研究結(jié)果不僅為研究哺乳動(dòng)物系統(tǒng)發(fā)育提供了新的核基因分子標(biāo)記，而且對(duì)疣猴亞科類群適應(yīng)性進(jìn)化機(jī)制的研究具有重要的進(jìn)化意義。本論文將新篩選的50個(gè)核基因非編碼區(qū)應(yīng)用到解決新大陸猴系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，并成功擴(kuò)增到4

6、9個(gè)基因片段，加上已經(jīng)發(fā)表的13個(gè)核基因非編碼區(qū)，共62個(gè)核基因非編碼區(qū)片段(37kb)。新大陸猴包括5個(gè)科，即絨猴科(Callithrichidae)，卷尾猴科(Cebidae)，蜘蛛猴科(Atelidae)，僧面猴科(Pitheciidae)和青猴科(Aotidae)，其中青猴科在新大陸猴類群中的系統(tǒng)發(fā)育位置至今仍存在爭(zhēng)議，本研究通過(guò)分析來(lái)自18個(gè)新大陸猴物種和4個(gè)非新大陸猴物種基于62個(gè)核基因非編碼區(qū)片段分析認(rèn)為青猴科與絨猴科關(guān)系