20863.甜瓜屬ty1copia類逆轉(zhuǎn)座子分析及其對(duì)異源四倍體遺傳變異的影響研究

1、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文甜瓜屬Ty1copia類逆轉(zhuǎn)座子分析及其對(duì)異源四倍休遺傳變異的影響研究姓名：江彪申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：蔬菜學(xué)指導(dǎo)教師：陳勁楓201106甜瓜屬Tyl吒印婦類逆轉(zhuǎn)座子分析及其對(duì)異源四倍體遺傳變異的影響研究所有染色體，并在末端異染色質(zhì)區(qū)成簇狀分布2甜瓜屬異源多倍化對(duì)兩1唧缸類逆轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄活性的影響為了研究甜瓜屬異源多倍化對(duì)新合成異源四倍體中Tylc印蛔類逆轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄活性的影響，利用RTPCR從異源四倍體C細(xì)咖淞及其

2、二倍體親本(C枷施和Cs口咖淞)中擴(kuò)增逆轉(zhuǎn)錄酶基因結(jié)果僅在異源四倍體中獲得了目的片段，回收測(cè)序后共獲得18個(gè)高度異質(zhì)的序列有義突變和無(wú)義突變分析暗示這些逆轉(zhuǎn)座子序列主要受凈化選擇影響。RTPCR和gPCR分析驗(yàn)證了逆轉(zhuǎn)錄酶基因在甜瓜屬異源四倍體早期四個(gè)世代中的表達(dá)，證實(shí)這些逆轉(zhuǎn)座子的活性是由異源多倍化造成的3逆轉(zhuǎn)座子對(duì)甜瓜屬異源四倍體早期世代基因組變異的影響為了檢測(cè)逆轉(zhuǎn)座子對(duì)甜瓜屬異源四倍體基因組變異的影響，本文以野生酸黃瓜C伽晰髓與栽

3、培黃瓜C刪柵的正反交種問(wèn)雜種Fl、異源四倍體C砂咖凇早期世代(C^聲護(hù)打作母本)及其二倍體親本為材料進(jìn)行SSAP分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)正反交Fl及異源四倍體均發(fā)生廣泛的序列變異，包括親本條帶的丟失和新增條帶的出現(xiàn)，正反交條帶丟失數(shù)和新增條帶數(shù)基本沒(méi)有差異無(wú)論是條帶丟失還是增加，均主要發(fā)生在Fl、Sl和S2代，因此推測(cè)異源四倍體早期基因組變異是一個(gè)快速的過(guò)程同時(shí)利用基于逆轉(zhuǎn)座子的分子標(biāo)記腳和l也MAP以及微衛(wèi)星標(biāo)記ISSR等，研究甜瓜屬新合成異源四

4、倍體早期世代的基因組變異結(jié)果共檢測(cè)出28個(gè)變異條帶，包括24個(gè)親本丟失條帶和4個(gè)新增條帶，表明基因組變異主要表現(xiàn)為親本序列丟失在這24個(gè)丟失序列中，18個(gè)是酸黃瓜特異序列，4個(gè)是栽培黃瓜特異序列，另2個(gè)是雙親共有序列，暗示序列丟失可能與親本基因組的組成相關(guān)而且大部分變異出現(xiàn)在Sl代，并能在隨后三個(gè)世代(S2S4)中穩(wěn)定遺傳，表明基因組變異是一個(gè)快速的過(guò)程，促進(jìn)異源四倍體穩(wěn)定形成進(jìn)一步對(duì)發(fā)生變異的序列進(jìn)行回收測(cè)序，共獲得11個(gè)序列比對(duì)分析