甜瓜屬Ty1-copia類逆轉(zhuǎn)座子分子標(biāo)記的開發(fā)及應(yīng)用.pdf

1、逆轉(zhuǎn)座子廣泛分布于植物界，是轉(zhuǎn)座元件中數(shù)量最多的一類。Ty1-copia類逆轉(zhuǎn)座子是植物中研究較為深入的一類，其以RNA為中介，采用“復(fù)制-粘貼”的方式進(jìn)行轉(zhuǎn)座，對(duì)植物基因組大小、結(jié)構(gòu)、進(jìn)化等都有重要影響。逆轉(zhuǎn)座子在植物基因組中拷貝數(shù)多，異質(zhì)性高，并且在種內(nèi)和種間表現(xiàn)出較高的序列差異性和豐富的插入多樣性，基于這些特點(diǎn)開發(fā)的逆轉(zhuǎn)座子分子標(biāo)記成為遺傳多樣性研究和遺傳連鎖圖譜及性狀定位的重要工具。
　　 黃瓜是我國(guó)主要蔬菜作物之一，也

2、是世界性重要蔬菜。多年的人工選育和及栽培的雜優(yōu)化，使黃瓜自然資源的多樣性受到侵蝕，栽培品種的遺傳背景變得更為狹窄。因此開展甜瓜屬逆轉(zhuǎn)座子分子標(biāo)記的開發(fā)及其應(yīng)用研究，將對(duì)甜瓜屬作物的遺傳多樣性分析和抗病基因的發(fā)掘具有重要意義，并且為甜瓜屬的分子育種開拓了新的道路。
　　 1.甜瓜屬IRAP分子標(biāo)記技術(shù)的建立根據(jù)甜瓜屬Ty1-copia類逆轉(zhuǎn)座子的長(zhǎng)末端重復(fù)序列信息，通過逆轉(zhuǎn)座子引物設(shè)計(jì)及擴(kuò)增體系優(yōu)化，建立起了適合于甜瓜屬的IRAP

3、(inter-retrotransposon amplifiedpolymorphism)標(biāo)記系統(tǒng)。進(jìn)一步將該標(biāo)記用于甜瓜屬不同類型材料間的聚類分析，發(fā)現(xiàn)該標(biāo)記能有效地檢測(cè)不同類型間的多態(tài)性，可成為構(gòu)建指紋圖譜新的標(biāo)記系統(tǒng)。
　　 2.甜瓜屬REMAP分子標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用基于甜瓜屬Ty1-copia類逆轉(zhuǎn)座子的長(zhǎng)末端重復(fù)序列信息，結(jié)合ISSR引物序列，在體系優(yōu)化的基礎(chǔ)上建立了適用于甜瓜屬物種的REMAP（Retrotranspo

4、son-microsatellite Amplified Polymorphism）標(biāo)記系統(tǒng)。通過對(duì)46份甜瓜屬不同類型材料進(jìn)行聚類分析，證明該標(biāo)記系統(tǒng)能有效檢測(cè)甜瓜屬不同類型材料間的多態(tài)性，可以用于甜瓜屬作物品種鑒定及指紋圖譜構(gòu)建。
　　 3.基于逆轉(zhuǎn)座子分子標(biāo)記和種間漸滲的甜瓜屬野生抗霜霉病相關(guān)基因的發(fā)掘利用逆轉(zhuǎn)座子分子標(biāo)記cDNA-SSAP從酸黃瓜和抗霜霉病漸滲系ILDM10-4中得到霜霉病菌接種后差異表達(dá)基因片段58條。